书目详细信息
： 基于全基因组重测序对保山猪选择信号分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 基于全基因组重测序对保山猪选择信号分析/.吴正明著/.赵桂英指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.6 |
| 载体形态项： | 65页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2020210386 |
| 提要文摘： | 保山猪是我国云南地方猪种，具有肉质细嫩、香味浓郁、产仔多、母性好、适应性强、耐粗饲、抗病力强等优良特性；但存在生长速度慢、瘦肉率低等不足；且由于保山猪的分布范围和存栏数量不断减少，种内遗传多样性降低。本研究通过对12头保山猪进行全基因组重测序，检测其基因组内的SNPs，以亚洲野猪、杜洛克猪为参考群，结合Fst和π ratio联合分析进行选择信号检测，以前1%为置信区间，对保山猪受选择区域内的基因进行GO、KEGG富集分析及QTL定位映射，筛选保山猪种质特性相关候选基因。结果如下： （1）全基因组重测序结果：共获得339.12G原始数据，质控后获得123 386 277个SNP位点，遗传变异多位于基因间区，内含子区次之，外显子区存在的变异数目最少，变异类型转换大于颠换，同义突变多于错义突变。 （2）以亚洲野猪为参考群，保山猪共鉴定出779个受选择区域，包含377个基因，其潜在受选择区域多与猪瘟抗体水平、免疫、日增重、PH等QTLs重叠；并注释到保山猪与免疫和疾病相关的NCOA7、NLRC3、ZC3H10基因，与胴体和肉质相关的LIPE、ECI1、HMGA1基因，与繁殖相关的CSN1S1、AKT2基因，与毛色相关的MC1R基因。 （3）以杜洛克猪为参考群，保山猪共鉴定出212个受选择区域，包含159个基因，其潜在受选择区域多与猪瘟抗体水平、免疫、背膘厚、胴体长等QTLs重叠；并注释到保山猪与免疫和疾病相关的NCOA7、ABCA3、NLRC3基因，与生长发育相关的MEF2A、CKM、CKMT2、LIPE基因，与繁殖相关的RSPO3、MARK4、AURKC基因，与糖代谢相关的PFKM基因。 本研究通过全基因组重测序技术结合选择信号分析，筛选到与保山猪生长、繁殖、免疫、疾病、肉质、代谢、毛色相关候选基因，初步揭示了保山猪种质特性的遗传基础，为保山猪的保种、选育、特色分子标记的挖掘提供参考依据。 |
| 并列题名： | Analysis of Selection Signatures in Baoshan Pigs based on Whole Sequencing Data eng |
| 题名主题： | 保山猪 全基因组重测序 选择信号 候选基因 学位论文 |
| 中图分类： | S828.89-533 |
| 个人名称等同： | 吴正明 著 |
| 个人名称次要： | 赵桂英 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240513 |