ISBN/价格: | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
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作品语种: | chi |
出版国别: | CN 530000 |
题名责任者项: | 三种植物中蜜蜂残翅病毒分离株基因组学及蛋白组学研究/.王艺桦著/.张炫指导 |
出版发行项: | 2023.5.30 |
载体形态项: | 82页:;+图表:;+30cm |
一般附注: | 动物科学技术学院, 学号2020210381 |
提要文摘: | 蜜蜂在世界范围内作为主要的农业传粉昆虫,对农作物产量的提升具有重要意义。每年我国都由于受到蜜蜂病毒病的流行与爆发而损失大量蜂群,其中蜜蜂残翅病毒(Deformed wing virus,DWV)作为蜜蜂病毒的代表之一,由于其世界范围广泛存在,并通过与多种病原联合危害野生及饲养蜂群,是导致蜂群数量不断下降的一个主要因素。众所周知,RNA蜜蜂病毒具备寄主寿命短、突变率高以及跨物种传播的特点,蜜蜂残翼病毒存在于多种昆虫中,如狄斯瓦螨(Varroa destructor)、蜂箱小甲虫(Aethina tumida)、熊蜂(Bombus Spp.),以及蜂群周围的蜜源植物,是研究蜜蜂病毒跨种传播和感染的极佳材料。为此,利用基因组学和蛋白组学的相关技术,深入研究蜜蜂残翅病毒在蜜蜂与开花植物间的差异,将为研究蜜蜂病毒跨物种传播、感染机制研究奠定了基础。本研究具体结果如下: (1)三种植物中叶子花BSW(Bougainvillea spectabilis Willd.)、迎春花JNL(Jasminum nudiflorum Lindl.)和紫藤WS(Wisteria sinensis)的蜜蜂残翅病毒核苷酸序列分析显示,DWV-BSW、DWV-JNL、DWV-WS全长分别为10140bp、10141bp以及10140bp,GC含量分别为38.43%、38.29%、38.63%,编码开放阅读框分别为3个、1个、1个,与其他28种DWV病毒株相比,DWV-BSW、DWV-JNL和DWV-WS的核苷酸序列同一性分别为76.3%-97.4%、76.3%-97.4%以及76.0%至96.9%。 (2)DWV-BSW、DWV-JNL、DWV-WS氨基酸序列显示,DWV-BSW、DWV-JNL、DWV-WS开放阅读框分别编码2893、2891以及2893个氨基酸,其中包含结构蛋白与非结构蛋白。DWV-BSW、DWV-JNL、DWV-WS三者基因组结构与参考基因组基本相似,开放阅读框中先导蛋白(Leader protein,Lp)区域的核苷酸同一性差异显著,DWV-BSW、DWV-JNL和DWV-WS的平均同一性分别为86.97%、87.32%和86.97%。 (3)DWV-BSW、DWV-JNL、DWV-WS系统发育树显示,DWV-BSW、DWV-JNL、DWB-WS在地理分布的亲缘关系上与DWV-2C1、DWV-LiaoNing1、DWV-HeBei1、DWV-JiangXi1同属中国地区的病毒株形成一个分支;在基因型方面DWV-BSW、DWV-JNL、DWB-WS属于DWV-A型,其中DWV-A型在亚洲、欧洲、美洲均有分布,DWV-B型主要在欧洲分布,而DWV-C型仅在英国有所发现。物种多样性方面,DWV-A型存在广泛是DWV跨物种传播的主力,DWV-B型则以意大利蜜蜂为主要寄主。 (4)DWV-BSW、DWV-JNL、DWV-WS重组分析显示,检测到在DWV-BSW、DWV-JNL以及DWV-WS三条全基因组序列中发生的重组事件共有11个(5个事件可信度高)。其中DWV-BSW在VP1、Helicase、VPg、3C-Pro RdRp以及3'UTR区域推测发生重组事件,DWV-WS则集中在VP3、VP4、VP1三个区域,而DWV-JNL与DWV-BSW情况相似,但其特殊之处在5'UTR(761-1877)断点位置处出现重合,可见重组事件基本涵盖了整个全基因组序列。 (5)BSW、JNL、WS三种植物各组织中DWV分布的调查结果显示,在三种植物的花、叶、茎三个组织中均能检测到DWV,且花组织的检测阳性概率明显大于叶、茎组织,表明DWV可能在蜜蜂向植物传播过程中受花朵大小和颜色的影响。 (6)采用蔗糖密度梯度离心法对三种植物中DWV进行分离纯化,并采用透射电镜观察以及聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进行鉴定。结果显示,WS中存在与蜜蜂体内DWV相似的VP1、VP2、VP3结构蛋白。最后经过LC-MS/MS质谱分析,共鉴定到病毒蛋白41个,鉴定到的肽类片段与DWV-2C1具有最高的同一性(24.1%),肽类片段与DWV-WS、DWV-2C1之间共27个氨基酸位点发生突变。 (7)使用人工注射病毒液的方法,我们比较了纯化后DWV-WS和DWV-BEE的毒力,并量化两者对蜜蜂的危害程度。结果表明,随着DWV-WS和DWV-BEE两种病毒注射后,蜜蜂白眼蛹的羽化率以及DWV病毒拷贝量并无明显差异,DWV-WS与DWV-BEE具有相似毒力。 综上所述,三种植物中的DWV分离株,其全基因组序列、病毒蛋白结构、病毒类型以及毒力方面均与DWV-2C1病毒株相似,表明植物中DWV极有可能由同一地区蜜蜂中的DWV演变进化而来,两者间比对形成的27个氨基酸突变位点,可能是DWV突破植物自身免疫机制,进而感染植物细胞的重要位点。 |
并列题名: | The genome and proteome of the isolated strains of Deformed wing virus from three plants |
题名主题: | 残翅病毒 开花植物 基因组学 蛋白组学 毒力 学位论文 |
中图分类: | S895.2-533 |
个人名称等同: | 王艺桦 著 |
个人名称次要: | 张炫 指导 |
团体名称等同: | 云南农业大学 授予 |
记录来源: | CN YNAUL 20240301 |