书目详细信息
： 大型迪庆藏猪脂质代谢相关基因时空表达差异及调控网络分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 大型迪庆藏猪脂质代谢相关基因时空表达差异及调控网络分析/.王琳著/.严达伟指导 |
| 出版发行项： | 2022.12.30 |
| 载体形态项： | 89页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2019210297 |
| 提要文摘： | 脂肪含量作为猪重要的经济指标之一，根据解剖部位的不同，可分为皮下脂肪、内脏脂肪和肌内脂肪，不同部位脂肪经济价值不同，其选育的方向也不同。大量研究表明，脂质代谢是一个复杂且精细的调控过程，不同时期和不同脂肪组织中脂质代谢速率不同，具有时空特异性，但关于猪脂质代谢时空调控机制尚不完全明确，可用于靶向调控猪脂肪沉积的分子标记有限。因此，筛选猪脂质代谢功能基因，解析猪脂质代谢时空调控机制，对生产中脂肪的靶向调控以促进畜牧养殖的高质量发展具有重要意义。 本研究以40kg、80kg、120kg大型迪庆藏猪的背部皮下脂肪和腹膜脂肪为对象，测定其平均背膘厚、6-7肋间膘厚、板油率等胴体性状，取背部皮下脂肪和腹膜脂肪组织进行转录组测序，通过差异表达基因筛选、GO和KEGG通路分析、基因互作网络分析，筛选调控不同时空脂质代谢相关基因，主要结果如下： （1）随大型迪庆藏猪阶段性生长，平均背膘厚、6-7肋间膘厚和板油率均随体重增加而显著增加，80kg到120kg增幅均低于40kg到80kg增幅，且在三个体重阶段，腹膜脂肪沉积率均高于背部皮下脂肪沉积率。 （2）40kgvs.80kg、80kgvs.120kg和40kgvs.120kg背部皮下脂肪分别筛选到845个、558个和1 049个差异表达显著基因；40kgvs.80kg、80kgvs.120kg和40kgvs.120kg腹膜脂肪分别筛选到1 517个、486个和1 752个差异表达显著基因；40kg-背部皮下脂肪vs.腹膜脂肪、80kg-背部皮下脂肪vs.腹膜脂肪和120kg-背部皮下脂肪vs.腹膜脂肪分别筛选到486个、765个和339个差异表达显著基因。 （3）背部皮下和腹膜脂肪差异表达基因功能富集分析显示：差异表达基因多富集于脂质代谢过程、脂肪细胞分化、脂肪细胞因子信号通路、甘油磷脂代谢、糖酵解/糖异生、PPAR信号通路、细胞外基质、催产素信号通路、Hippo信号通路等与脂质代谢相关的生物学通路。 （4）不同体重背部皮下脂肪差异基因互作网络分析显示：SPP1、HDAC6、ACOX1、VEGFC、AQP3、CPT1B位于40kgvs.80kg互作网络核心；FFAR4、PCK1、GATA3、GRB10位于80kgvs.120kg互作网络核心；ID4、EGR2、PPP1R3C、PTGER3、LPIN3、ANGPTL4、ADIPOQ位于40kgvs.120kg互作网络核心。 （5）不同体重腹膜脂肪差异基因互作网络分析显示：PTPN11、WNT10B、IL10、VEGFC、AQP3、CPT1B位于40kgvs.80kg互作网络核心；SFRP2、HILPDA、GATA3、GRB10位于80kgvs.120kg互作网络核心；WWTR1、PPP1R3C、PTGER3、LPIN3、ANGPTL4、ADIPOQ位于40kgvs.120kg互作网络核心。 （6）比对不同体重背部皮下脂肪和腹膜脂肪核心基因，获得10个背脂和腹膜共表达差异基因，其中，VEGFC、AQP3、CPT1B、GATA3在不同体重腹膜脂肪间的差异表达变化大于背部皮下脂肪，与腹膜脂肪沉积率高于背部皮下脂肪有关。 （7）不同脂肪组织差异基因互作网络分析显示：RARRES2、EGR2、SFRP2、TMOD4位于40kg-背部皮下脂肪vs.腹膜脂肪基因互作网络核心；THBS1、PPARA、NRIP1、LPL位于80kg-背部皮下脂肪vs.腹膜脂肪基因互作网络核心；LRRK2、TSHR、SHOX2、SOD3、STC2、HTRA1位于80kg-背部皮下脂肪vs.腹膜脂肪基因互作网络核心。 （8）不同生长阶段背部皮下脂肪和腹膜脂肪差异基因qPCR验证显示：随机选取16个差异基因进行qPCR验证，ACOX1、CPT1B等16个基因在背部皮下脂肪和腹膜脂肪中的表达模式与转录组测序结果一致。 本研究通过转录组数据分析，构建大型迪庆藏猪不同体重阶段背部皮下脂肪和腹膜脂肪脂质代谢转录调控网络，筛选到35个脂质代谢核心基因，其中SPP1、FFAR4、ID4等17个核心基因精细调控背部皮下脂肪脂质代谢，促进背部皮下脂肪随体重阶段性增长而显著增加；PTPN11、SFRP2、WWTR1等16个核心基因精细调控腹膜脂肪脂质代谢，促进腹膜脂肪随体重阶段性增长而显著增加；EGR2、THBS1、TSHR等14个核心基因精细调控背部皮下脂肪和腹膜脂肪脂质代谢差异。研究结果可为解析地方猪脂质代谢时空调控机制提供基础数据，为迪庆藏猪的靶向选育提供参考。 |
| 并列题名： | Spatio-temporal expression differences and regulatory network analysis of lipid metabolism related genes in large Diqing Tibetan pigs eng |
| 题名主题： | 大型迪庆藏猪 RNA-Seq 背部皮下脂肪 腹膜脂肪 脂质代谢 学位论文 |
| 中图分类： | S829.9-533 |
| 个人名称等同： | 王琳 著 |
| 个人名称次要： | 严达伟 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240604 |