书目详细信息
： 水稻低温胁迫响应的半胱氨酸蛋白酶基因OsCysP7的等位基因多样性分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 水稻低温胁迫响应的半胱氨酸蛋白酶基因OsCysP7的等位基因多样性分析/.王丹著/.徐津, 袁平荣指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.8 |
| 载体形态项： | 40页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 农学与生物技术学院, 学号2021240196 |
| 提要文摘： | 水稻是重要的粮食作物，容易受到低温冷害的影响。DNA甲基化是植物表观遗传的重要方式，在调控植物抵御逆境胁迫等过程中发挥着重要的作用。另一方面，开展水稻种质多样性的研究对水稻优异基因的挖掘和应用也具有重要意义。 本研究首先通过对籼稻品种9311在低温胁迫下全基因组甲基化变化进行分析，然后利用98个云南地方品种、8个东北地区推广品种以及常规粳稻日本晴，对其中一个在低温胁迫下在编码序列存在甲基化变化的半胱氨酸蛋白酶基因OsCysP7的等位基因多样性进行分析。结果表明： 籼稻全基因组中，CpG和CHG基序均具有较多的甲基化位点数，是基因组内主要的甲基化位点，而CHH基序的甲基化位点数则较少。低温胁迫下，甲基化的CHG位点数量减少，说明CHG位点的甲基化可能在籼稻响应冷害胁迫中具有重要的调控功能。 对籼稻基因组不同功能区域甲基化水平的分析表明，启动子区域具有较高的甲基化水平。低温胁迫后的籼稻在基因的5’非编码区、3’非编码区以及外显子区的CHH位点的甲基化水平均低于正常生长条件下的CHH位点甲基化水平，产生了脱甲基化现象。 低温胁迫下，籼稻基因组甲基化水平显著降低。有742个基因产生了甲基化变化，其中196个基因序列的DNA甲基化水平上升，而有546个基因发生了DNA甲基化水平降低现象。GO分析表明，甲基化变化相关基因富集到18个生物过程，其中8个过程富集显著。KEGG分析表明，甲基化变化相关基因集中在次生代谢产物，光合天线蛋白等生物学途径。 通过对98个云南地方品种、8个东北地区推广品种以及常规粳稻日本晴分析表明，以序列中存在的碱基缺失插入为标准OsCysP7基因存在3种等位基因类型。 37个云南地方品种具有等位基因OsCysP7(1)，其中籼稻19个，粳稻品种16个，值得注意的是很多旱稻品种都具有OsCysP7(1)等位基因。 具有等位基因OsCysP7(2)品种一共有54个。其中籼稻16个，粳稻品种37个，包括大多数种植于云南中海拔地区的地方粳稻资源。另外8个东北地区推广品种和日本晴也具有该等位基因。 具有OsCysP7(3)等位基因的品种有16个，其中14个粳稻品种。值得注意的是，多数种植于海拔1950米以上的地方粳稻种质都具有该等位基因。因此OsCysP7(3)等位基因可能是高寒稻区水稻品种自然选择的结果，有必要对该等位基因在水稻低温适应性生长中的功能开展进一步的分析。 |
| 并列题名： | Allele diversity analysis of a low temperature stress responsing cysteine protease gene OsCysP7 in rice eng |
| 题名主题： | 水稻 低温胁迫 DNA甲基化 生态多样性 半胱氨酸蛋白酶 学位论文 |
| 中图分类： | S511-533 |
| 个人名称等同： | 王丹 著 |
| 个人名称次要： | 徐津 指导 |
| 个人名称次要： | 袁平荣 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |