书目详细信息
： 水稻OsGT1(t)编码序列DNA甲基化籼粳间差异分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00(估)缴送 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 水稻OsGT1(t)编码序列DNA甲基化籼粳间差异分析/.刘超著/.徐津, 谭亚玲指导 |
| 出版发行项： | 2019.05.31 |
| 载体形态项： | 40页:;+图表:;+30cm |
| 提要文摘： | DNA甲基化是基因组表观遗传修饰研究的热点之一，目前很多基因编码序列上的甲基化已经是一种普遍现象，但目前对于基因编码序列上DNA甲基化产生的分子机制以及生物学功能的了解仍然十分有限。本研究利用来源于云南不同生态区域的地方水稻种质资源117份，其中籼稻49份，粳稻68份，以及普通野生稻样品12份，通过分析籼稻、粳稻以及野生稻GALT基因编码序列708-971bp上DNA甲基化的差异，以及水稻不同组织器官中OsGT1(t)基因编码序列上DNA甲基化的异同，从而揭示水稻在不同生态区域的进化中以及野生种到栽培稻的驯化中GALT基因编码序列上DNA甲基化的变化规律。主要结果如下： 1.通过对水稻OsGT1(t)编码序列上DNA甲基化的分析，发现在所研究的该段序列上总共有89个胞嘧啶位点，其中全部胞嘧啶位点上均可检测到甲基化的发生。水稻在该段序列上的平均甲基化水平为2.41%，与其3’端之后的序列相比甲基化水平偏低，直到向3’端推移至该段序列末端才出现较高水平的甲基化位点。另外，在所研究的该段序列上除了CG位点的C可被甲基化之外，大量CHG和CHH位点上的C也可以被甲基化。并且三种不同类型甲基化位点之间的甲基化水平差异较大，其中甲基化水平相对较高的位点全部都发生在CG位点上，所有CHG和CHH位点的甲基化水平都非常低。 2.通过对籼粳稻OsGT1(t)编码序列上DNA甲基化的分析，发现在所研究的该段序列上的89个胞嘧啶位点中，在所有籼稻材料中检测到可以发生甲基化的位点有87个，在所有粳稻材料中检测到可以发生甲基化的位点有80个，并且从被检测到可以发生甲基化的CG、CHG、CHH位点来看，籼稻发生甲基化的位点都明显多于粳稻。虽然籼稻可以被甲基化的位点多于粳稻，但是籼稻中被检测到位点的甲基化水平都非常低。通过计算该段序列的平均甲基化水平发现，籼稻在该段序列上的平均甲基化水平为1.71%，而粳稻在该段序列上的平均甲基化水平为2.95%，粳稻在该段序列的平均甲基化水平明显高于籼稻。并且发现籼粳稻OsGT1(t)编码序列上的甲基化都主要发生在CG位点上，粳稻中CG位点的甲基化水平远远高于籼稻，但是籼粳稻中CHG和CHH位点之间的甲基化水平差异不大。 3.通过对野生稻OrGT1(t)基因编码序列上DNA甲基化的分析，发现野生稻在所研究的该段OrGT1(t)基因编码序列上的89个胞嘧啶位点中，检测到发生甲基化的胞嘧啶位点仅有30个，占该段序列胞嘧啶位点的33.71%。并且野生稻在该段序列上的甲基化水平在0.83-3.33%之间，在该段序列上的平均甲基化水平为1.17%，明显低于栽培稻在该段OsGT1(t)编码序列上的平均甲基化水平。 4.通过对水稻不同组织器官中OsGT1(t)基因编码序列上DNA甲基化的分析，发现在所研究的该段序列上水稻不同组织器官中OsGT1(t)基因的甲基化水平是不同的，其中在该段序列上水稻胚中DNA甲基化的水平最高，其甲基化水平为0.89%，而胚乳中的甲基化水平最低，其甲基化水平仅为0.39%。 |
| 并列题名： | Analysis of DNA methylation of OsGT1 (t) coding sequence between indica and japonica rice difference eng |
| 题名主题： | 水稻 GALT基因 DNA甲基化 进化 学位论文 |
| 中图分类： | S336-533 |
| 个人名称等同： | 刘超 著 |
| 个人名称次要： | 徐津 指导 |
| 个人名称次要： | 谭亚玲 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20200305 |