书目详细信息
： 月季bHLH基因家族的全基因组鉴定及其对灰霉菌（Botrytis cinerea）的响应
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 月季bHLH基因家族的全基因组鉴定及其对灰霉菌（Botrytis cinerea）的响应/.Ikram Ullah著/.吴红芝指导 |
| 出版发行项： | 2023.5.12 |
| 载体形态项： | 99页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 园林园艺学院, 学号2018230012 |
| 提要文摘： | 月季（Rosa spp.），属蔷薇科薔薇属植物，为世界四大切花之一，在全球占有举足轻重的地位。由于月季种植业的快速和集约化发展，月季病害日益严重，尤其是由灰霉菌（Botrytis cinerea）引起的灰霉病害，造成月季严重的采前和采后损失，尤其时采后损失，使月季生产遭受严重破坏。bHLH是植物中一个大型转录因子家族，参与许多重要的生理过程，包括参与植物的生长、发育和病菌侵染防御反应等。bHLH基因家族的基序存在于所有真核生物中，但它们与单一蛋白质的关联是植物独有的。bHLH基因是一个包含60个氨基酸的DNA结合域，分别具有两个不同的功能域：第一个为N-末端的10-17个氨基酸结合位点，第二个为C-末端的具有40个氨基酸的HLH区域。基于它们的结构、序列保守性、功能特征和与DNA结合的能力，bHLH分为6个主要类型（从A到F）。 本研究从月季（Rosa chinensis）基因组数据库中鉴定了100个bHLH（RcbHLH）基因，并进行了系统发育分析、保守基序分析、染色体作图、GO富集和转录组学分析。此外，根据课题组前期完成的两个抗/感月季品种（A29和XS）灰霉菌侵染前后的转录组数据，筛选出95个RcbHLH基因，并从中筛选获得14个胁迫前后显著差异表达的基因进行实时荧光定量（qRT-PCR）表达谱分析。利用B. cinerea孢子液接种，检测14个基因分别在两个抗/感月季品种中的表达情况，结果显示14个bHLH家族基因在抗性月季品种和感病月季品种中的表达不同。RcbHLH基因表达分析为月季防控基因功能研究提供了新的认识。研究取得的主要结果如下： 1. 从月季基因组数据库中鉴定获得100个编码bHLH蛋白的bHLH基因，命名为RcbHLH1-RcbHLH100，这些基因在染色体上分布不均，7号染色体分布最多共20个，3号染色体分布最少共7个。大多数RcbHLHs基因定位于细胞核中，但RcbHLH82和RcbHLH83定位于质膜中。 2. 利用氨基酸序列基因构建了最大似然系统发育树，深入了解月季和拟南芥bHLH蛋白的进化关系。此外，根据已建立的bHLH分类及其来自拟南芥的同源序列，bHLH蛋白序列家族被分为21个亚家族，并测量了每个亚家族中月季bHLH蛋白的数量。在RcbHLH中，XII亚家族的RcbHLH数量最多（13个基因），而II、IV（d）、VIII（b）和XIV亚家族的数量最少，分别各有1个基因。此外，RcbHLH的个体数量在每个亚家族中都有所不同。 3. 对月季和拟南芥比较共线性分析的结果表明，月季的RcbHLH与拟南芥的AtbHLH表现出共线性，说明植物的bHLH基因可能是从共同的祖先进化来的。但月季的5号、6号、7号染色体与拟南芥没有任何相同的碱基。 4. 在RcbHLHs基因的进化中，鉴定到43对串联和片段重复（综合分析）。其中5号染色体上的RcbHLH55 和RcbHLH53、1号染色体上的RcbHLH8 和 RcbHLH12、4号染色体上的T RcbHLH33 on chromosome 3 和RcbHLH37 显示出自我复制。 5. 对顺式调节元件进行了评估，发现了生长、激素和应激相关元件。 6. 对接种灰霉菌后的月季抗性品种（A29）和感病品种（XS）的差异表达基因（DEG）进行了GO和KEGG富集分析。GO富集结果表明，RcbHLH在信号转导、细胞和生长相关的生物过程以及催化和酶活性、DNA结合、膜腔、细胞连接和不同细胞器中发挥作用。鉴定了环境胁迫、植物病原相互作用、激素信号传导和其他与KEGG途径相关的转录因子。 7. In-silico蛋白相互作用结果显示，82个蛋白之间存在互作，而其余18个蛋白没有与任何bHLH蛋白互作。 8. bHLH蛋白的三维（3D）结构预测分析显示，RcbHLH蛋白90-96%的区域显示出高度适合的区域，表明预测的蛋白结构具有较好的稳定性和质量。 9. 为了分析RcbHLH基因在B. cinerea胁迫期间的表达，利用FPKM（每百万映射读取的每千碱基转录本片段数）数据生成和绘制RcbHLH成员在成熟阶段表达水平的热图。分别对B. cinerea胁迫下前后转录组测序分析筛选获得的14个显著差异表达的RcbHLH基因在耐受（A29）和敏感（XS）的两个月季品种中进行了qRT-PCR表达分析与验证。两个品种中，RcbHLH基因在灰霉菌侵染前没有显著的差异，但在B. cinerea处理12h时，感病品种XS的RcbHLH43、RcbHLH63显示上调，而 RcbHLH22、RcbHLH35、RcbHLH41、RcbHLH49和 RcbHLH94 显示下调；B. cinerea处理48小时，与抗病品种A29相比，RcbHLHI3、RcbHLH35、RcbHLH41、RcbHLH44和RcbHLH-49基因在感病品种XS中上调，并显著高表达，而RcbHLH30、RcbHLH62和RcbHLH66基因表达量在两个品种中没有显著差异。鉴于上述结果，推测RcbHLHs成员可能参与减轻生物胁迫，这一发现为其功能研究提供重要线索，以及对今后的实际应用具有启发意义。 |
| 并列题名： | Genome-wide Identification of bHLH Gene Family in Rose (Rosa chinensis) and Its Response to Botrytis cinerea Infection |
| 题名主题： | 月季 生物胁迫 灰霉菌 碱性螺旋-环-螺旋 (bHLH) 表达 学位论文 |
| 中图分类： | S68-533 |
| 个人名称等同： | Ikram Ullah 著 |
| 个人名称次要： | 吴红芝 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |