ISBN/价格: | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
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作品语种: | chi |
出版国别: | CN 530000 |
题名责任者项: | 云南牛结节性皮肤病流行病学调查及流行毒株的分离鉴定/.李雪著/.王生奎, 姚俊指导 |
出版发行项: | 2023.06.01 |
载体形态项: | 60页:;+图表:;+30cm |
一般附注: | 动物医学院, 学号2021240435 |
提要文摘: | 为了解云南省牛结节性皮肤病(Lumpy Skin Disease,LSD)的发生和流行情况,以及LSDV云南流行毒株的遗传变异特征,本文对云南省部分地区饲养牛群开展了LSD病原学及血清学流行病学调查,同时进行了LSDV云南流行毒株的分离鉴定及其全基因组序列的测定和分析。 本文采用LSDV抗体检测ELISA试剂盒,对2018-2023年间采集自云南省8个州市的1270份牛血清样品进行血清学检测,并建立LSDV qPCR和普通PCR检测方法,对2018-2023年间采集自云南省14个州市的2495份样品(包括环境样品、虫媒样品、血液样品等)开展病原学检测,对检出的LSDV核酸阳性样品进行GPCR基因及P32基因序列比对分析,同时制备绵羊睾丸原代细胞(ovine testicular primary cells)开展LSDV云南流行毒株的分离鉴定工作,并运用二代测序方法对LSDV云南分离毒株进行全基因序列测定和分析。 实验结果显示:1、血清样品LSDV抗体检测结果总阳性率为34.33%(436/1270),云南省存栏牛LSDV抗体阳性率普遍偏低,仅大理某规模场抗体阳性率较高,为59.52%。2、本文成功建立了LSDV的TaqMan 探针法实时荧光定量PCR和普通PCR检测方法,其中qPCR方法最低可检测出4.83拷贝/μL的LSDV DNA,建立的标准曲线线性方程y=-3.755x+40.445,R2=0.9986,E=98.48%。临床样本检测结果显示该检测方法特异、灵敏、可靠、可重复性好,可应用于LSDV临床样品的病原学检测。3、采集样品的病原学检测总阳性率为0.24%(6/2495),其中从5个州市饲养牛群里采集的样品里检出6份呈LSDV核酸阳性,检出LSDV核酸阳性样品均为皮肤痂垢或溃烂液样品,其他的内脏组织病料、血液、环境及虫媒(蚊、蜱、蛾)样品均未检出。4、LSDV核酸阳性样品的GPCR基因和P32基因扩增及序列比对分析结果显示:6株LSDV云南流行株的GPCR基因序列与国内外的15株流行毒株的同源性介于98.1%~99.2%之间,P32基因序列与其他地区的13株LSDV流行株的同源性在99.1%~100%之间,与山羊痘和绵羊痘的同源性均在97%以上。GPCR基因及P32基因遗传进化分析结果显示:云南流行毒株与中国LSDV-XJ-2019株、泰国YST株、俄罗斯Khabarovsk株亲缘性高,均位于同一分支。GPCR氨基酸突变位点分析结果显示:云南流行毒株与参考株LSDV-XJ-2019株相比,LSDV怒江毒株存在第4位点突变(I→F),LSDV普洱1号毒株存在第4位点突变(I→F),LSDV曲靖毒株存在第346位点突变(X→F),其余毒株没有发现变异位点。P32氨基酸突变位点分析结果显示:云南流行毒株与参考株LSDV-XJ-2019株相比,LSDV怒江毒株存在第8位点的突变(X→N),LSDV玉溪毒株存在第376位点的突变(I→X),其余毒株没有发现位点变异。5、成功从云南玉溪地区采集的牛皮肤痂垢样品中分离获得1株LSDV流行毒株,将其命名为LSDV-YNYX-2022毒株,测得其TCID50为10-5.875/0.1mL,全基因组测序结果显示其大小为145884个核苷酸,将其核苷酸序列与国内外10株LSDV参考毒株比对分析,同源性介于99.2%~100%之间;遗传进化分析结果显示其与9株国内外流行毒株亲缘关系较近,在同一个分支,与LSDV弱毒疫苗株Neethling株和俄罗斯Saratov株相比亲缘关系较远。其氨基酸位点与泰国YST株比较,分离株存在第14042位点突变(S→P)、第44827位点突变(H→P)及第44933位点缺失。 本研究结果可为LSD的防控及候选疫苗毒株筛选提供重要理论数据参考。 |
并列题名: | Epidemiological investigation of bovine nodular dermatosis and isolation and identification of epidemic strains in Yunnan eng |
题名主题: | 牛结节性皮肤病病毒(LSDV) 云南流行毒株 分离鉴定 流行病学调查 学位论文 |
中图分类: | S857.5-533 |
个人名称等同: | 李雪 著 |
个人名称次要: | 王生奎 指导 |
个人名称次要: | 姚俊 指导 |
团体名称等同: | 云南农业大学 授予 |
记录来源: | CN YNAUL 20240301 |