ISBN/价格: | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
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作品语种: | chi |
出版国别: | CN 530000 |
题名责任者项: | 蓝舌病病毒17型核酸标准物质的制备及BTV qRT-PCR检测方法的建立/.陈朝林著/.李文贵, 艾军指导 |
出版发行项: | 2023.6.9 |
载体形态项: | 69页:;+图表:;+30cm |
一般附注: | 动物医学院, 学号2021240460 |
提要文摘: | 蓝舌病(Bluetongue,BT)是由蓝舌病病毒(Bluetongue virus,BTV)引起的一种通过吸血库蠓传播的虫媒病毒病,牛、羊等反刍动物对其易感,目前尚无有效的治疗方法。世界动物卫生组织(World Organisation for Animal Health,WOAH)将BT列为法定上报的多种动物共患疫病,我国将其列为二类动物疫病。针对目前没有BTV核酸标准物质相关文献的发表,BTV核酸检测缺少全毒株这类核酸标准物质,无法对样本进行质控等问题,开展了BTV-17核酸标准物质的制备和含内参的BTV实时荧光定量RT-PCR(Real-time quantitative RT-PCR,qRT-PCR)方法的建立相关研究。 1、BTV-17核酸标准物质的制备、定值与应用 本研究对BTV-17型毒株进行增殖培养,灭活分装冻干,并采用建立的BTV?qRT-PCR对BTV-17悬浮液进行浓度检测、均匀性初检、灭活性检测,制备了BTV-17核酸标准物质;对已冻干的BTV-17核酸标准物质进行物理性状检验、灭活检验、支原体检验及纯粹性检测。随机抽取样品进行均匀性、短期稳定性及长期稳定性考察。BTV-17核酸标准物质呈黄色松散状固体。将灭活的BTV-17接种于BHK-21细胞盲传三代后,各代次细胞均无细胞病变,经qRT-PCR检测各代病毒量依次递减,说明BTV-17已经灭活。进行支原体检验,结果均为阴性。纯粹性检测除BTV-17有扩增曲线外,其他病毒均无扩增。随机抽取10瓶标准物质进行均匀性检验,结果显示样品是均匀稳定的。BTV-17核酸标准物质在-20℃、4℃、25℃、37℃条件下,可存放9天;在-80℃、-20℃、4℃、25℃条件下均没有显著差异,均可存放6个月。BTV-17核酸标准物质在定值时采用多个实验室合作定值的方式,协同3家实验室进行协作定值,同时对多家定值的数据进行统计分析。将均匀性、稳定性以及定值过程中的不确定度进行统计分析,得出BTV-17核酸标准物质的标准值为9.15×106?copies/μL,扩展标准不确定度(k=2)为5.55×105?copies/μL,最终BTV-17核酸标准物质的表示结果为(9.15±0.56)×106?copies/μL。 2、含内参基因的BTV?qRT-PCR方法的建立 参考2022年世界动物卫生组织《陆生动物诊断与疫苗陆地手册》中针对BTV NS3基因的特异性引物和探针,同时设计了一对内参基因GAPDH引物和探针,构建标准品pUC57-BTV-NS3和pUC57-GAPDH,分别用于qRT-PCR中NS3基因及内参基因GAPDH标准曲线的构建。通过对反应条件进行优化,建立了以GAPDH为内参基因的检测BTV qRT-PCR方法。结果显示,建立的方法与流行性出血病病毒、牛病毒性腹泻病毒、口蹄疫病毒、小反刍病毒、羊口疮病毒、山羊痘病毒、水泡性口炎病毒不存在交叉反应,具有良好的特异性,该方法检测BTV和GAPDH阳性质粒标准品的最低检出量分别6.685?copies/μL、1.9×102?copies/μL,BTV检测Ct值的组内和组间变异系数均小于1.2%,GAPDH检测Ct值的组内和组间变异系数均小于0.7%,具有较好的重复性。采用建立的BTV?qRT-PCR方法对88份实验室保存的羊血清样品进行检测,阳性率为4.55%,并与WOAH推荐的检测BTV的套式PCR进行比较,结果表明两种方法检测结果符合率为100%,但qRT-PCR方法操作更为简便,结果准确,更适用于大量临床样品的检测。 综上所述,本研究制备了BTV-17核酸标准物质,对该标准物质进行协作定值,提供可靠的参考值;建立了含内参基因的BTV qRT-PCR检测方法,加入内参基因对样本进行质控,提升了检测的准确性。本研究有利于完善BTV核酸检测体系,推动BT检测方法的标准化。 |
并列题名: | Preparation of nucleic acid reference material for Bluetongue virus type 17 and establishment of BTV qRT-PCR assay eng |
题名主题: | 蓝舌病病毒 核酸标准物质 qRT-PCR 内参基因 学位论文 |
中图分类: | S855.3-533 |
个人名称等同: | 陈朝林 著 |
个人名称次要: | 李文贵 指导 |
个人名称次要: | 艾军 指导 |
团体名称等同: | 云南农业大学 授予 |
记录来源: | CN YNAUL 20240301 |