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： 基于斑马鱼肌间刺发育图谱的比较转录组学及关键基因表达模式研究
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 基于斑马鱼肌间刺发育图谱的比较转录组学及关键基因表达模式研究/.赵玉姣著/.孔令富指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.7 |
| 载体形态项： | 84页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2020210390 |
| 提要文摘： | 肌间刺是低等真骨鱼类肌隔中的膜性硬骨，纤细、密集的特点给含有肌间刺的鲤科鱼类的直接食用和深加工带来极大的困扰，严重影响其产业发展。本研究以斑马鱼为研究对象，通过软硬骨染色，观察斑马鱼肌间刺的形态发育，绘制出斑马鱼肌间刺连续发育图谱，确定斑马鱼肌间刺发育的关键阶段；对关键发育阶段进行斑马鱼肌间刺比较转录组研究，筛选参与调控肌间刺发育的关键基因；同时利用原位杂交确定肌间刺发育关键基因的表达模式。主要研究内容如下： （1）通过软硬骨染色的方法作肌间刺连续发育图谱，发现斑马鱼肌间刺的发育在中轴骨骼骨化之后开始的，由尾部向头部骨化，只存在髓弓小骨和脉弓小骨两种肌间刺，平均总数为84.17。且鱼体左右两侧肌间刺数目并不完全相同，但相差不大，斑马鱼头部骨骼骨化也同时进行，且比肌间刺率先完成骨化。本研究进一步确定斑马鱼肌间刺发育的4个关键节点：20 dpf（Days Post Fertilization, dpf）（体长7.10 mm）肌间刺未发生骨化；24 dpf（体长7.80 mm）尾部少量肌间刺骨化；33 dpf（体长12.30 mm）肌间刺大量生长，至1/2鱼体；60 dpf（体长24.00 mm）肌间刺基本骨化完成。该研究为肌间刺的分子发育机制研究提供理论基础。 （2）对斑马鱼肌间刺发育4个关键节点的尾部肌肉组织（含有肌间刺）进行转录组测序，并完成比较转录组学分析。对所有差异表达基因进行GO功能富集和KEGG通路富集，共筛选出97个与骨骼发育相关的候选基因；将97个候选基因与bmp6、runx2b进行蛋白网络互作分析，最终筛选出runx2b、bmp6、spp1、mef2ca、pls3共5个候选基因。进一步利用加权基因共表达网络分析，将差异表达基因与肌间刺发育趋势、矿化过程、发育时间相关联，鉴定到核心差异表达基因ognb作为表达模式研究的候选基因。 （3）通过整胚原位杂交的方法，研究6个基因在早期胚胎中的时空表达模式，结果显示：runx2b、bmp6、spp1、mef2ca、pls3和ognb 6个基因在早期斑马鱼胚胎肌节中都有表达，进一步证明这6个基因都参与斑马鱼肌间刺形成的过程，为深入探究其在肌间刺发育过程中的调控机制奠定基础。 综上所述，本研究对斑马鱼肌间刺发育的过程进行了发育图谱骨染色，明确斑马鱼肌间刺发育的基本规律，确定发育的4个关键时间点；同时对4个关键时间点进行转录组测序分析，从中筛选出与肌间刺发育相关的6个关键候选基因；利用原位杂交技术，获得6个关键候选基因的时空表达模式，为鱼类肌间刺分子机制的研究提供了科学数据基础。 |
| 并列题名： | Comparative transcriptomics analysis and expression patterns study of key genes in Zebrafish based on developmental atlas of intermuscular bones |
| 题名主题： | 斑马鱼 肌间刺 发育图谱 比较转录组 原位杂交 学位论文 |
| 中图分类： | S93-533 |
| 个人名称等同： | 赵玉姣 著 |
| 个人名称次要： | 孔令富指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |