书目详细信息
： 云南部分地区牛诺如病毒的分子流行病学调查及全基因组序列分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 云南部分地区牛诺如病毒的分子流行病学调查及全基因组序列分析/.郭红瑞著/.张以芳指导 |
| 出版发行项： | 2023.05.29 |
| 载体形态项： | 76页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物医学院, 学号2021240443 |
| 提要文摘： | 牛诺如病毒（Bovine norovirus，BNoV）属于杯状病毒科，诺如病毒属的RNA病毒，是国内新发的犊牛腹泻的病原之一，已在世界各国养殖业广泛流行，在粪便、消化道中长期存在并快速传播。BNoV的高变异性、多宿主性以及存在潜在人兽共患风险值得我们对其深入研究，其多存在于奶牛、肉牛中，且多呈隐性感染或混合感染，尽管BNoV 已被证实在中国的存在，但其在云南地区的流行及分子特征仍不清楚，应当引起养牛业的重视。因此，建立针对BNoV的高效检测方法及分子检测研究，为科学防控BNoV提供理论依据。 本研究在对BNoV保守区分析的基础上，建立了BNoV普通RT-PCR及Real-time RT-PCR方法，对云南省13个地区15个牛场所收集的655份牛粪便样品进行感染情况检测，并对部份BNoV阳性样品的全基因进行基因测序及遗传进化分析，研究获得以下结果： （1）建立BNoV的普通RT-PCR检测方法，最低检测量为9.67×103?copies/μL；检测出阳性份数25份，阳性率3.82%。同时建立BNoV的Real-time RT-PCR检测方法，最低检测量为9.67×10?0?copies/μL；检测出阳性份数32份，阳性率4.89%。两种检测方法均具有良好特异性、敏感性、稳定性。 （2）不同年龄BNoV检测结果：1周龄、1周龄~1月龄、1月龄~6月龄和1岁以上粪便样品中BNoV检出率分别为15.00%（3/20）、15.93%（18/113）、1.87%（6/321）、2.49%（5/201）。腹泻样品和非腹泻样品BNoV检出率分别为8.99%(25/ 278)、1.86%(7/ 377)。奶牛、肉牛、牦牛粪便样品BNoV检出率分别为5.92%（32/540）、0%（0/104）、0%（0/11）。 （3）对BNoV阳性样品进行RdRp基因片段扩增测序，获得6株RdRp序列，分别命名为BNoV-YN01?~ 06-2022，与33株参考株进行遗传进化分析，表明：云南6株同在一个进化分支上，均属于BNoV GIII.2型；6株云南株间核苷酸同源性94.0%~98.4%。 （4）设计13对特异性引物对阳性样品进行全基因扩增测序，分别命名为BNoV-YN01-2022、BNoV-YN02-2022，长度分别为7281bp、7293?bp，包括部分5’UTR和3’UTR及三个完整的开放阅读框。具有典型BNoV基因组结构，在ORFl和ORF2重叠区交界处均存在一段高度保守的核苷酸序列ATGAAGATGACTGA?(5075?bp -5088?bp)。与33株参考序列遗传进化分析显示：两株毒株间核苷酸同源性为97.6%；与中国新疆毒株同处一个分支上，发育进化也与其聚拢，同源性最高，同属GIII.2型。RDP4软件重组预测分析，2株全基因组仅有BNoV-YN02-2022株在ORF3（VP2）区域存在基因重组情况，亲本主要为中国新疆毒株和挪威毒株。其与GIII.2原始毒株Bo/Newbury2/1976/UK衣壳蛋白预测及氨基酸位点突变分析显示：BNoV-YN01-2022衣壳蛋白与原始毒株衣壳蛋白结构相似，BNoV-YN02-2022衣壳蛋白表面可能性、蛋白亲水性和抗原指数均有所改变，这种改变与氨基酸位点突变相对应，主要集中在P高变区域，以上结果揭示BNoV或许通过这种重组和突变适应进化，为后续免疫检测方法应用打下基础，有助于深入研究蛋白结构和功能的关系。 |
| 并列题名： | Molecular epidemiological investigation and whole genome sequence analysis of bovine norovirus in some areas of Yunnan eng |
| 题名主题： | 牛诺如病毒 分子流行病学 全基因组序列 学位论文 |
| 中图分类： | S823-533 |
| 个人名称等同： | 郭红瑞 著 |
| 个人名称次要： | 张以芳 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |