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： 鸡NRAMP1基因的分子特征及其与鸡白痢沙门氏菌感染的相关性研究
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 鸡NRAMP1基因的分子特征及其与鸡白痢沙门氏菌感染的相关性研究/.朱单著/.张永云指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.15 |
| 载体形态项： | 63页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物医学院, 学号2020210402 |
| 提要文摘： | 鸡白痢是威胁现代家禽业发展的细菌性疾病之一，该病不仅造成雏鸡大量死亡，而且隐性感染会造成鸡群生长迟缓和生产性能降低，给养殖业造成巨大的经济损失。目前控制鸡白痢感染的方法有接种疫苗、抗生素控制及净化，但这些都不能从根本上解决问题。分子标记辅助选择已成为抗病育种工作的重要手段，从基因或基因组水平上筛选出抗病能力强的种用个体，进而培育抗病力强的品种，是抵抗病原微生物最有效的方法之一。 研究发现天然抗性相关巨噬细胞蛋白基因（NRAMP1）在宿主先天性防御中起至关重要的作用，该基因与感染小鼠和鸡的沙门氏菌抗性和易感性相关，但在云南地方鸡上关于该基因的研究较少。基于此，本研究通过全血平板凝集试验和核酸检测将武定鸡和尼西鸡中所检验的个体分为感染组（阳性鸡）和未感染组（阴性鸡）；然后，采用RT-PCR技术从未感染武定鸡的胸腺组织中分离鉴定出鸡的NRAMP1基因，并采用生物信息学软件对NRAMP1及其编码蛋白的分子特征与功能进行了分析；采集未感染和感染的两组鸡胸腺组织各25份，小样本筛选NRAMP1基因编码区的突变位点，初步确定影响NRAMP1功能的突变位点；进一步在DNA水平上以武定鸡和尼西鸡为研究材料大样本检测功能突变位点的群体分布，确定其群体遗传学特征，并将单个突变位点与鸡白痢沙门氏菌抗性（性状）进行关联分析；再采用qPCR技术检测并比较重要突变位点不同基因型在感染组和未感染组的免疫重要器官胸腺和脾脏组织中NRAMP1基因表达水平，确定该基因变异与鸡白痢沙门氏菌抗性的相关性。结果如下： （1）鸡NRAMP1基因CDS区序列长1668 bp，编码555个氨基酸。NRAMP1蛋白有11个跨膜结构域，无信号肽，具有一个SLC超家族保守结构域（AA61～461）。该蛋白属于疏水性跨膜蛋白，通过将二价金属离子从吞噬体内腔转运到细胞质，改变吞噬小体内环境，从而控制病原微生物的增殖。 （2）在武定鸡的NRAMP1基因中共检测到八个突变位点，仅出现在exon2、exon8和exon9上，分别为c.163A>G、c.668G>A、c.756C>T、c.801A>C、c.822C>T、c.891C>G、c.919G>和c.933C>T，其中SNP801、SNP822和SNP891处于Hardy-Weinberg不平衡状态（P<0.05）。在尼西鸡的exon2、exon8和exon9上共检测到五个突变位点，分别是c.163A>G、c.801A>C、c.891C>G、c.919G>A、c.933C>T、c.1068C>T和c.1158C>T，其中SNP801处于Hardy-Weinberg不平衡状态（P<0.05）。位于exon2上的SNP163、exon8上的SNP668和exon9上的SNP919核苷酸替换分别引起了三处相应的氨基酸替换，即p.T55A、p.R223Q和p.V307I。在NRAMP1基因所发现的突变位点中，仅exon2上的c.163A>G替换在感染组和未感染组中基因型频率差异显著（P<0.05），其余位点差异均不显著，揭示c.163A>G突变位点可能与鸡白痢沙门氏菌的抗性相关，且该位点的AA为抗性基因型。 （3）未感染组胸腺和脾脏组织中NRAMP1基因mRNA表达水平高于感染组，但差异不显著（P>0.05）。SNP163（A>G）在所检测的鸡群中存在AA、AG和GG三种基因型，在未感染组胸腺和脾脏组织中NRAMP1基因表达量高于感染组，且GG基因型表达量高于AA和AG基因型，但差异均不显著（P>0.05）。 本研究揭示了鸡中NRAMP1基因的分子特征及功能，阐明了武定鸡和尼西鸡NRAMP1基因变异的群体遗传特征，初步确定该基因与鸡白痢沙门氏菌的感染抗性相关，以上结果对武定鸡和尼西鸡的未来的抗病育种具有重要价值。 |
| 并列题名： | Molecular characteristics of NRAMP1 gene and its correlation with salmonella pullorum infection eng |
| 题名主题： | NRAMP1基因 生物信息学分析 鸡白痢沙门氏菌 单核苷酸多态性 关联分析 学位论文 |
| 中图分类： | S858.31-533 |
| 个人名称等同： | 朱单 著 |
| 个人名称次要： | 张永云 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240528 |