书目详细信息
： 基于atp6基因的水稻CMS基因起源及疣粒野生稻谱系地理分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00(估)缴送 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 基于atp6基因的水稻CMS基因起源及疣粒野生稻谱系地理分析/.李平著/.张雪梅指导 |
| 出版发行项： | 2019.5.29 |
| 载体形态项： | 41页:;+图表:;+30cm |
| 提要文摘： | 细胞质雄性不育基因均为嵌合线粒体基因，而线粒体DNA为母性遗传。已知水稻多个细胞质雄性不育基因均涉及atp6基因。为探讨水稻细胞质雄性不育基因起源及疣粒野生稻的谱系地理关系，我们采用水稻线粒体atp6基因特异性引物，通过PCR检测产于我国的普通野生稻12个居群311个个体、疣粒野生稻8个居群155个个体、药用野生稻4个居群84个个体、33个亚洲栽培稻地方老品种165个个体及1个亚洲栽培稻三系杂交稻丰优香占5个个体。并自每个居群/品种中随机选取2个个体分别对其扩增产物测序。结果显示： （1）在普通野生稻、地方老品种和丰优香占中检测到扩增产物，随机抽取测序的95个个体序列完全一致，均为水稻线粒体atp6基因保守序列。在药用野生稻中没有检测到扩增产物。在疣粒野生稻中共检测到5个单倍型（H1, H2, H3, H4, H5），它们与atp6基因保守序列的相似度低，最高为45.19%。 （2）疣粒野生稻5个单倍型间共计17个变异位点，云南省澜沧、普洱、勐海野谷、勐海蚌俄居群共同拥有单倍型H1，单倍型H2与H3分别为云南省新平及墨江居群特有，单倍型H4及H5分别为海南省保亭和崖城居群特有。 （3）5个单倍型分为云南组和海南组时，两组组内平均遗传距离均为0，组间平均遗传距离为0.02；组间遗传分化系数Fst为92.08%，遗传分化较大，基因流Nm为0.04，组间基本不存在基因交流。组间遗传分化系数Nst（0.92178）> Gst（0.12953），且P<0.05，疣粒野生稻的分布具有明显谱系地理结构。变异位点数（S）、单倍型数（h）、核苷酸多样性（Pi）均显示：云南组（4, 3, 0.00201）疣粒野生稻居群的遗传多样性大于海南组（1, 2, 0.00131）；云南组疣粒野生稻居群的单倍型多样性（Hd）为0.6，海南组为1。 （4）云南省的澜沧（YD）、普洱（GB）、勐海野谷（YG）、勐海蚌俄（BE）、新平（XP）、墨江（MJ）6个疣粒野生稻居群亲缘关系较近，海南省的保亭（BT）与崖城（YC）居群亲缘关系较近。澜沧、普洱及勐海一带可能是疣粒野生稻的起源地。 （5）云南、海南两地间亲缘关系较近的单倍型分布在地理分布较近的居群中。中性检验Tajima's D值为0.91089，且P>0.05，差异不显著，疣粒野生稻整个群体在进化过程中符合中性进化模型。失配分析为多峰曲线，疣粒野生稻整个群体在进化过程中处于动态平衡，没有经历快速扩张过程，只是在长期进化过程中的生殖隔离增加了居群间的分歧。 |
| 并列题名： | Origin of rice CMS gene based on atp6 gene and pedigree geographical analysis of Oryza meyeriana eng |
| 题名主题： | atp6基因 水稻 序列分析 起源 DNA条形码 学位论文 |
| 中图分类： | Q37-533 |
| 个人名称等同： | 李平 著 |
| 个人名称次要： | 张雪梅 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20200319 |