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： 基于DNA条形码技术对中国石斛属植物的鉴定
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00(估)缴送 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 基于DNA条形码技术对中国石斛属植物的鉴定/.高静著/.张敬丽指导 |
| 出版发行项： | 2019.5.30 |
| 载体形态项： | 118页:;+图表:;+30cm |
| 提要文摘： | 石斛属是兰科的一个大属，是重要的种质资源植物。中国石斛属资源丰富，花型奇特，花色艳丽，大多数物种散发香气，具有较高的观赏价值和经济价值。石斛属植物因种类繁多复杂，很多植物形态特征极其相似，肉眼难以分辨，且种源较为混杂，故在石斛新品种选育以及资源开发利用的过程中对于石斛种类的精确鉴定尤为重要；另外，石斛属植物根、茎可入药，有益胃生津、滋阴清热的功效，在防治疾病方面具有一定的功效，不同的石斛种类药效不尽相同，但常与混伪品混淆。为解决以上问题，亟需找到能够对中国石斛属植物快速准确鉴定的方法。本文以《中国植物志》记载的其中49种石斛属植物为主要研究对象，以ITS、ITS2、psbA-trnH和matK四条序列作为鉴定中国石斛属的条形码序列。主要研究结果如下： 1、在石斛属植物中，ITS、ITS2、psbA-trnH和matK四个序列的扩增成功率均为100%。ITS和ITS2序列的测序成功率最高为98.6%，其次是matK序列为97.8%，测序成功率最低的序列是psbA-trnH，为96.6%，四条序列的测序成功率都高达96%以上。 2、经过序列特征分析发现，石斛属保守度较高的是psbA-trnH序列，变异度最高的是ITS2序列。在四条序列的CG含量中，ITS序列的含量最高，为53.5%，最低的是matK序列，为32%。 3、在石斛属DNA条形码的四条序列中，种内和种间遗传距离平均值最高的是ITS2序列，其次是ITS序列，平均值最低的是matK序列。说明ITS2序列的变异度最高，matK序列的变异度最低，相对保守。 4、ITS和ITS2序列与psbA-trnH和matK序列相比，存在较明显的Barcoding Gap现象。 5、对石斛属DNA条形码的四个单片段以及五个序列组合的物种鉴定可靠性做了综合评价，结果发现，ITS序列的识别率最高为94.32%，matK序列的识别率最低为84.23%。在组合片段中ITS+matK+psbA-trnH+ITS2的准确鉴定率最高，为97.94%，其次是ITS+matK+psbA-trnH组合片段，准确鉴定率为97.17%。 6、本研究构建了石斛属四个单独片段以及五个片段组合的NJ树。单独的片段中，ITS和ITS2序列的聚类最为理想，组合片段中ITS+psbA-trnH 组合片段的物种鉴定率最高，ITS+matK+psbA-trnH和ITS+matK+psbA-trnH+ITS2组合片段的物种单系性较高，每个物种分支的支持率高达95%以上。在含有ITS或ITS序列的所有树中，剑叶组、圆柱叶组和基肿组聚为一个大支，亲缘关系较近。禾叶组和草叶组的石斛都各自聚为一个大支，其他组的石斛虽然没有按照各组聚集在一起，大多数也都各自聚为单系分支，且有较高的支持率。四条单个片段的NJ树及五个序列组合构建的NJ树均未达到预期区分全部物种的效果，石斛组的霍山石斛和细茎石斛未能成功鉴定。综合分析，推荐以ITS序列为主，psbA-trnH序列为辅作为鉴定中国石斛属植物的候选DNA条形码序列。 |
| 并列题名： | Identification of Dendrobium species in China based on DNA Barcode Technology eng |
| 题名主题： | 石斛属植物 DNA条形码 系统发育分析 物种鉴定 学位论文 |
| 中图分类： | S567.239-533 |
| 个人名称等同： | 高静 著 |
| 个人名称次要： | 张敬丽 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20200313 |