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： 云南部分地区牛环曲病毒流行病学调查及结构蛋白基因分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 云南部分地区牛环曲病毒流行病学调查及结构蛋白基因分析/.王鑫文著/.张以芳指导 |
| 出版发行项： | 2023.05.31 |
| 载体形态项： | 106页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物医学院, 学号2021240445 |
| 提要文摘： | 随着国内养牛业的蓬勃发展，牛肠道腹泻综合症越来越受到大众的关注，牛环曲病毒（Bovine Torovirus，BToV）作为引起牛肠道腹泻的病毒之一，已在我国牛群中流行，目前在国内针对BToV的流行病学调查鲜见报道。尤其在云南省内无相关研究报道。而BToV具有很强的基因重组能力和潜在的人兽共患病的风险，需要给予重视。因此为了了解并掌握BToV在云南的流行特点、变异规律进化趋势，补充云南省BToV流行数据资料，进行了BToV分子流行病学研究。 本次研究通过RT-PCR方法对云南省9个市13个县区15个牛场采集的粪便样品，进行BToV与其他腹泻病毒（BVDV、BCoV、BRV、BNoV、BAstV、BNeV、BEV）感染情况检测分析，对具有代表性BToV阳性样品，进行结构蛋白完整基因（S、M、HE、N）扩增、克隆测序。并采用生物信息学的方法对云南地区的BToV结构蛋白基因进行分子特性、遗传进化、重组信号和进化趋势分析。检测和分析结果显示： 1、云南省9个市13个县区15个牛场665份牛临床样品检测出BAstV、BToV、BCoV、BNeV、BVDV、BNoV、BEV和BRV阳性样品354份，总体阳性率为54.05%（354/655）。八种病毒在云南奶牛养殖较集中的地区阳性率高，阳性率从高到底依次为BAstV、BToV、BCoV、BNeV、BVDV、BNoV、BEV和BRV，阳性率分别为12.8%（84/655）、10.8%（71/655）、9.3%（61/655）、7.0%（46/655）、6.7%（44/655）、3.8%（25/655）、2.7%（18/655）和0.8%（5/655）。经检测发现1周龄~1月龄的奶犊牛阳性率和感染病毒种类最复杂，其中BToV、BAstV和BCoV阳性率最高。BToV在成年奶牛样品和非腹泻样品中均检出，另外BToV与BAstV、BNeV混合呈二重或三重感染。以上表明云南部分地区同时存在八种腹泻病毒感染，且牛腹泻病原种类多且存在混合感染，另外新发病毒BToV已在云南广泛流行，且存在隐性感染，实际阳性率更高，应给予重视。 2、对具有代表性的BToV阳性样品扩增、克隆、测序得到了6株云南奶牛源BToV结构蛋白基因序列，本研究中的云南奶牛源BToV S、M、HE、N基因的核苷酸同源性分别为96.0%~99.8%、96.3%~99.6%、69.1%~98.9%和98.4%~100%之间。遗传进化分析表明4个结构蛋白基因具有所在分支具有差异，其中HE基因进化程度更快，更适合对毒株分型鉴定；通过HE基因遗传进化分析表明云南地区同时存在BToVⅡ型和BToV Ⅲ型毒株流行，与国内目前的流行毒株基因型一致，在进化树中与国内四川、黑龙江流行毒株具有较近的亲缘关系其核苷酸同源性为96%~99.6%，推测云南毒株与国内毒株具有共同的祖先，云南奶牛源BToV与四川省奶牛和牦牛源BToV可能都是由国内奶牛BToV传播而来。氨基酸突变位点分析表明，S、M、HE、N基因均存在一些独特的氨基酸突变，这些氨基酸的突变可能与BToV在感染过程中适应云贵高原多样性的气候环境产生的适应性变异有关。 3、对云南奶牛源BToV毒株结构蛋白基因重组分析。发现S基因预测出3个重组毒株，亲本为国外毒株和本次研究中的毒株，重组区域主要存在于S1基因，在S2亚基也发现了重组信号。HE基因出现跨物种重组现象，预测出的2个重组毒株，亲本为BToV Ⅱ型毒株和青藏高原藏羚羊源毒株，重组区域位于凝集素结构域R中间区域。对多物种ToV遗传进化分析表明，AToV处于BToV Ⅲ型分支中，与重组毒株亲缘关系较近；表明云南奶牛源毒株S基因可能存在国外毒株与云南本土毒株基因重组现象，HE基因可能存在跨物种基因重组和跨物种传播的风险，需要进一步研究。 4、对BToV结构蛋白基因选择压力分析，表明BToV S、M、HE、N基因，在宿主机体和生存环境中进化趋势主要以中性选择为主。 本研究通过对云南地方流行毒株分子流行病学研究，可为后续BToV防控与监测、诊断试剂研发、结构蛋白功能分析、发病机制以及疫苗研发等相关研究提供一定科学依据。 |
| 并列题名： | Epidemiological investigation and structural protein gene analysis of bovine torovirus virus in Yunnan Province eng |
| 题名主题： | 牛环曲病毒 流行病学调查 结构蛋白 基因分析 学位论文 |
| 中图分类： | S855.3-533 |
| 个人名称等同： | 王鑫文 著 |
| 个人名称次要： | 张以芳 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |