书目详细信息
： 云南河口蝇类昆虫的COI和COII标记鉴定和系统分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00(估)缴送 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 云南河口蝇类昆虫的COI和COII标记鉴定和系统分析/.邵仕芳著/.吴毅歆指导 |
| 出版发行项： | 2019.6.10 |
| 载体形态项： | 169页:;+图表:;+30cm |
| 提要文摘： | 蝇类昆虫的鉴别方法主要依据成虫外部形态特征,而传统的形态学识别法对昆虫的卵和幼虫，则难以实现。本文通过对细胞色素C氧化酶亚基I（COI）和II（COII）两个基因作为分子标记，开展蝇类昆虫的分子鉴定，建立云南省蝇类的基因数据库，探明不同种属间遗传学关系。本试验取得如下结果： 1、本文提取了微生物诱剂在云南省河口地区诱捕的54份蝇类样品的基因组DNA，使用线粒体基因COI 和COII序列的通用引物进行PCR扩增，获得果蝇科COI基因序列39条，COII基因序列39条；丽蝇科COI序列31条，丽蝇科COII序列28条；蝇科COI序列40条，蝇科COII序列39条；实蝇科COI序列26条，实蝇科COII序列19条；花蝇科COI序列21条，花蝇科COII序列21条；厕蝇科COI序列18条，厕蝇科COII序列18条。通过形态学及分子鉴定，共有6科22属54种，即为果蝇科13种，丽蝇科10种，蝇科13种，实蝇科6种，花蝇科7种，厕蝇科5种。 2、6科23属54种昆虫COI、COII基因的种间遗传距离和种内遗传距离具有显著差异。COI基因计算结果表明，果蝇科、丽蝇科、蝇科、实蝇科、花蝇科、厕蝇科种间平均遗传距离分别为0.210、0.140、0.13、0.255、0.134、0.047；种内平均遗传距离分别为0.003、0.007、0.003、0.003、0.003、0.002。COII基因计算结果表明，果蝇科、丽蝇科、蝇科、实蝇科、花蝇科、厕蝇科种间平均遗传距离分别为0.222、0.250、0.214、0.084、0.226、0.058；种内平均遗传距离分别为0.003、0.007、0.003、0.002、0.003、0.004。COI和COII两种基因的种间遗传距离均是种内遗传距离的10倍以上，表明COI和COII两种基因的鉴定结果有效。且在铜绿蝇L. cuprina与丝光绿蝇L. sericata、亮绿蝇L. illustris和紫绿蝇L. porphyrina、东方芒蝇A. orientalis与中华毛庶芒蝇A. reversura、夏厕蝇F. canicularis与元厕蝇F. prisca等亲缘关系较近的物种鉴定上，COII基因鉴定结果更有效。 3、6科23属54种昆虫COI和COII基因及两种基因联合分析表明具有A+T碱基偏向性，符合昆虫线粒体基因的碱基使用偏向性。分析结果显示果蝇科、丽蝇科、蝇科、实蝇科、花蝇科、厕蝇科的COI基因片段碱基A+T平均含量分别为68.0％、68.2%、69.0%、64.6%、68.1、68.6；COII基因碱基A+T平均含量分别为72.7％、70.9%、74.1%、69.5%、73.6%、75.1%；COI和COII联合基因片段碱基A+T平均含量分别为70.3％、69.6％、69.6％、67.0％、70.9％、71.9％。密码子第一位点A+T平均含量最高为果蝇科、丽蝇科、花蝇科，分别为76.1％、90.1%、90.6%，密码子第二位点A+T平均含量最高为厕蝇科，为93.8%，密码子第三位点最高A+T平均含量最高为实蝇科和蝇科，分别为94.5%和90.6%。 4、6科23属54种昆虫COI和COII基因的密码子和氨基酸的使用也具有一定的偏向性。COI基因片段密码子UUU、UUA、AUU使用率最高，氨基酸Phe、Ile、Ser使用率最高。COII基因片段密码子UUU、UUA、AUU、AAU使用率最高，氨基酸Phe、Ile、Ser、Leu使用率最高。 5、基于COI、COII以及两个基因联合序列碱基转换与颠换分析发现，果蝇科、丽蝇科、蝇科、实蝇科、花蝇科、厕蝇科转换发生的频率均低于颠换。COI基因片段碱基替换分析表明果蝇科、丽蝇科、蝇科、实蝇科、花蝇科、厕蝇科转换数最高均发生在T-C之间，颠换数最高发生在T-A之间，转换与颠换比值分为0.7、0.7、0.6、0.8、0.8、0.9 。COII基因片段碱基替换分析结果显示果蝇科、丽蝇科、蝇科、实蝇科、花蝇科、厕蝇科转换发生的频率均低于颠换，比值分为0.7、0.9、0.7、0.8、0.8、0.9，除果蝇科外转换数最高均发生在T-C之间，颠换数最高发生在T-A之间。联合序列分析发现各科昆虫转换发生的频率均低于颠换，果蝇科、丽蝇科、蝇科、实蝇科、花蝇科、厕蝇科比值分别为0．7、0.8、0.7、0.8、0.9、0.9，除果蝇科最高转换数发生在A-G之间外，其余科转换数最高发生在T-C之间，颠换数最高均发生在T-A之间。各序列间存在不同程度的饱和。 6、采用MP、NJ、ML分别构建6科23属54种昆虫的系统发育树，在36个系统发育树中，同一基因不同建树方法相差不大，而不同基因构建同一科的系统发育树有明显区别，说明所选目的基因片段遵循不同的分类群及分类单元。6科昆虫均表现出COI基因建树效果比COII建树效果好，且COI在属级水平分类效果较好，COII分析结果较为混乱，在亚科之间存在一定的关系不足。果蝇科果蝇属不是一个单系群，且果蝇属与白果蝇属亲缘关系较近。丽蝇科中支持绿蝇属Lucilia不是一个单系群，绿蝇亚科、金蝇亚科为独立亚科。蝇科中，芒蝇属Atherigona 、黑角蝇属Haematobia、齿股蝇属Hydrotaea、重毫蝇属Dichaetomyia和腐蝇属Muscina都能很好聚集到一起。支持家蝇属Musca为一单系群；支持将螫蝇亚科Stomoxyinae作为一个族置于家蝇亚科Muscinae中。实蝇科中，木瓜实蝇与桔小实蝇存在同源交叉。花蝇科中，支持范滋德和万琪等分科体系，且种蝇属Hylemyza和花蝇属Anthomyia两者之间近源关系较近。厕蝇科中，夏厕蝇种团canicularis-group并非为一个单系群。 |
| 并列题名： | Identification and Systematical Analyses of Flies by COI and COII Markers in Hekou, Yunnan Province |
| 题名主题： | 蝇类 系统发育 鉴定 COI COII 学位论文 |
| 中图分类： | S433-533 |
| 个人名称等同： | 邵仕芳 著 |
| 个人名称次要： | 吴毅歆 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20200312 |