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： 高黎贡山猪繁殖相关基因HTRA3、HOXA13和ACVR1B的分子克隆、组织表达、多态性及关联分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 高黎贡山猪繁殖相关基因HTRA3、HOXA13和ACVR1B的分子克隆、组织表达、多态性及关联分析/.熊昕宜著/.刘永刚， 唐中林指导 |
| 出版发行项： | 2023.05.25 |
| 载体形态项： | 59页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2021240411 |
| 提要文摘： | 高黎贡山猪是云南省特有的地方猪种，低产仔数严重制约了高黎贡山猪的发展。HTRA3、HOXA13和ACVR1B是与繁殖相关的重要基因。本研究以高黎贡山猪为实验材料，通过RT-PCR克隆了高黎贡山猪HTRA3、HOXA13和ACVR1B基因的编码区序列，随后利用生物信息学工具，分析了三个基因的DNA及蛋白质序列特性。同时，利用实时荧光定量PCR方法，对这三个基因在猪不同组织部位的表达情况进行了分析，利用PCR-RFLP方法，对高黎贡山猪HTRA3基因编码区序列进行了多态性分析，并与200头高黎贡山母猪群体产仔数进行了关联分析，以探讨其是否可作为与繁殖性状相关的候选基因进行后续研究，本研究具体实验结果如下： 丝氨酸蛋白酶3（The high temperature requirement factor A serine peptidase 3，HTRA3），是猪繁殖重要相关基因。本研究克隆了高黎贡山猪HTRA3基因编码区全长，该编码区为1362 bp，编码453个氨基酸，该基因编码蛋白与马鹿、弯角羚羊、羊驼、水牛、亚洲狮分别具有96.74%、96.27%、96.27%、96.04%、94.87%的高度同源性。计算机辅助分析表明该基因基因组序列包含9个外显子和8个内含子，共24907 bp。猪基因数据库进一步比对分析发现猪HTRA3基因编码区存在41个突变位点。其编码区1140-bp处有一个G-A突变，形成一个HpaII限制性酶切位点。通过对有产仔数的高黎贡山母猪群体进行HTRA3基因PCR-HpaII-RFLP多态性分析及与产仔数关联分析，发现HTRA3基因多态性与产仔数相关，个体产仔性能比较表明，AA基因型优于AG及GG基因型，总体趋势AA>AG >GG。组织表达谱分析表明HTRA3基因在脾脏、肝脏、脂肪、肾脏中是中高度表达，在心脏、肌肉、肺脏、卵巢中是中度表达。 同源盒基因A13（Homeobox A13，HOXA13）也是猪繁殖相关的重要基因。本研究克隆了高黎贡山猪HOXA13基因编码区全长cDNA序列，编码214个氨基酸，该基因编码蛋白与孟加拉虎、山羊、貉、豹、棕熊分别具有99.47%、99.47%、99.47%、98%、99.47%的高度同源性。计算机辅助分析表明猪HOXA13基因的基因组序列包含3个外显子和2个内含子，长度为1884 bp。猪基因数据库进一步比对分析猪HOXA13编码区存在17个突变位点。通过对高黎贡山母猪HOXA13基因的编码区进行PCR扩增及测序，发现猪HOXA13基因编码区在群体中无多态性。组织表达谱分析表明HOXA13在肺脏、脾脏、肝脏中呈中高度表达，在心脏、肌肉、卵巢、脂肪和肾脏中呈中等表达。 激活素受体1B（Activin A receptor type 1B，ACVR1B）是另外一个与猪繁殖相关的基因。本研究克隆了ACVR1B基因编码区全长cDNA序列，编码505个氨基酸，该基因编码蛋白与骆驼、灰松鼠、湖羊、非洲象、黄腹土拨鼠、草原田鼠分别具有99.41%、99.8%、99.8%、99.8%、99.6%、99.6%的高度同源性。计算机辅助分析表明该基因的基因组序列包含9个外显子和8个内含子，长度为33430 bp。在猪基因数据库进一步比对分析发现猪ACVR1B基因编码区存在14个突变位点。通过对高黎贡山母猪ACVR1B基因的编码区进行PCR扩增及测序，发现猪ACVR1B基因编码区在群体中无多态性。组织表达谱分析表明ACVR1B在脾脏中呈中高度表达，在心脏、肌肉、肺脏、肝脏、卵巢、脂肪和肾脏中呈中等表达。 这些实验结果为猪HTRA3、HOXA13和ACVR1B基因是否能够作为猪繁殖相关候选基因的进一步深入研究奠定了分子基础。 |
| 并列题名： | Molecular cloning, tissue expression, polymorphism and association analysis of reproduction related genes-HTRA3, HOXA13 and ACVR1B in Gaoligong pigs eng |
| 题名主题： | 猪 HTRA3 HOXA13 ACVR1B 分子克隆 组织表达 多态性 学位论文 |
| 中图分类： | S813.1-533 |
| 个人名称等同： | 熊昕宜 著 |
| 个人名称次要： | 刘永刚 指导 |
| 个人名称次要： | 唐中林 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |