书目详细信息
： 基于GWAS挖掘大白猪生长性状的分子标记与候选基因
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 基于GWAS挖掘大白猪生长性状的分子标记与候选基因/.赖金花著/.鲁绍雄指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.28 |
| 载体形态项： | 48页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2020210357 |
| 提要文摘： | 生长性状是猪重要的经济性状之一，研究揭示其分子遗传基础对促进猪的遗传改良具有重要意义。迄今为止，有关猪生长性状的遗传基础仍不明晰。为发掘大白猪生长性状的SNP标记及候选基因，本研究利用Illumina 50K SNP芯片对499头大白猪全基因组SNP进行了检测，采用混合线性模型（mixed linear model, MLM）法对达30 kg体重日龄、达100 kg体重日龄、30~100 kg平均日增重、100 kg活体背膘厚、100 kg眼肌面积、100 kg眼肌厚6个生长性状进行了全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS），并对显著影响目标性状的SNP位点进行了基因注释和候选基因富集分析。主要结果如下： （1）基于SNP芯片技术的大白猪全基因组SNP检测。经基因分型、质控，在大白猪群体中共检出41311个有效SNPs，相邻SNP平均间距55.71～65.66 kb。 （2）基于GWAS检测大白猪生长性状的SNP标记。采用MLM对大白猪6个生长性状的GWAS结果，共在6条染色体上检出29个与生长性状显著关联的SNP位点。其中，在8号染色体上检出1个显著影响30-100 kg平均日增重的SNP；在5号（24个）和12号（1个）染色体上检出25个显著影响100 kg活体背膘厚的SNP；在7号、13号和16号染色体上各检出1个显著影响100 kg眼肌面积的SNP，其中16号染色体上的SNP也与100 kg眼肌厚显著关联。 （3）大白猪生长性状候选基因发掘。对显著影响目标性状的SNP位点进行基因注释与候选基因富集分析的结果提示：NDST3为30-100 kg平均日增重的候选基因，LMO3、PIK3C2G、PDE3A、SLCO1C1、SLCO1B3、SLCO1A2、KCNJ8、ABCC9、GYS2、SLC15A5、PLEKHA5、LDHB、MYO19为100 kg活体背膘厚的候选基因，PROX2、FOS、AREL1、DLST、NEK9、EBF1（同时影响100 kg眼肌厚）为100 kg眼肌面积的候选基因。 本研究挖掘的大白猪生长性状相关SNP位点和候选基因，进一步丰富了猪生长性状的分子标记，为应用分子育种技术促进猪生长性状的遗传改良提供了一定的科学依据。 |
| 并列题名： | GWAS-based Identification of Molecular Markers and Candidate Genes for Growth Traits in Large White Pigs eng |
| 题名主题： | 大白猪 生长性状 候选基因 全基因组关联分析 SNP芯片 学位论文 |
| 中图分类： | S813-533 |
| 个人名称等同： | 赖金花 著 |
| 个人名称次要： | 鲁绍雄 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240517 |