书目详细信息
： 基于深度测序鉴定西藏部分地区紫花苜蓿及周边杂草病毒种类
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 基于深度测序鉴定西藏部分地区紫花苜蓿及周边杂草病毒种类/.常峰华著/.陈功，兰平秀指导 |
| 出版发行项： | 2023.5.23 |
| 载体形态项： | 59页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2020210397 |
| 提要文摘： | 西藏近年来积极推进优质人工草地建设，促进当地畜牧业发展，优势牧草紫花苜蓿（Medicago sativa）被引进并种植。随着紫花苜蓿种植面积的扩大和种植年限的积累，病毒病逐渐发生并日渐严重，给西藏畜牧业的发展带来影响。为了明确西藏地区紫花苜蓿病毒病的病毒种类，本文对西藏自治区扎囊县、达孜县和林芝市部分地区紫花苜蓿及其周边杂草开展病毒病调查，采集疑似病毒病症状的紫花苜蓿样品211份、杂草样品139份，利用深度测序结合RT-PCR技术对其病毒病原进行鉴定，初步明确了西藏地区紫花苜蓿的主要病毒病种类，病毒在以上调查地区的危害及分布情况，为西藏地区紫花苜蓿病毒病的防控提供数理依据。具体结果如下： 病毒病在西藏自治区扎囊县、达孜县和林芝市的紫花苜蓿种植区均有发生，且病毒种类丰富，采集的211份疑似病毒病症状的紫花苜蓿样品中共检测到11种病毒，为苜蓿混合病毒1（medicago sativa amalgavirus 1，MsAV1）、苜蓿花叶病毒（alfalfa mosaic virus，AMV）、苜蓿暂时性线条病毒（lucerne transient streak virus，LTSV）、黄瓜花叶病毒（cucumber mosaic virus，CMV）、蛇床子脉黄化病毒（cnidium vein yellowing virus，CnVYV）、紫花苜蓿alpha双分病毒1（medicago sativa alphapartitivirus 1，MsAPV1）、菜豆黄花叶病毒（bean yellow mosaic virus，BYMV）、鬼针草斑驳病毒（bidens mottle virus，BiMoV）、烟草花叶病毒（tobacco mosaic virus，TMV）、芸苔黄化病毒（brassica yellows virus，BrYV）和紫花苜蓿伴生豇豆病毒1号（medicago sativa secovirus 1，MsSV1），其中紫花苜蓿伴生豇豆病毒1号为本文首次发现并暂时命名的伴生豇豆病毒科（Secoviridae）豇豆花叶病毒属（Comovirus）的新成员。11种病毒中，检出率最高的是BYMV，检出率为30.3%，其次为BrYV，检出率为18.5%。分布最广泛的病毒为MsAV1、AMV、LTSV和BrYV，在3个地区发生。这是MsAV1、AMV、LTSV、CnVYV、MsAPV1、BYMV、BiMoV和BrYV在西藏地区的首次报道，也是TMV在西藏苜蓿上的首次报道，CMV、BiMoV、BrYV在中国苜蓿上的首次报道。 对采集的139份疑似病毒病症状的杂草样品的检测，发现共有4种病毒的侵染，分别为白车轴草（Trifolium repens）上检测到AMV和MsAV1，箭筈豌豆（Vicia sativa）和蒲公英（Taraxacum mongolicum）中检测到MsAPV1，豌豆（Pisum sativum）中检测到TMV，4种病毒的检出率都较低，分别为4.3%、2.9%、5%和1.4%。这是AMV在西藏白车轴草、MsAV1在白车轴草以及MsAPV1在箭筈豌豆和蒲公英上的首次报道，也是TMV在西藏豌豆上的首次报道。AMV、TMV、MsAV1和MsAPV1在苜蓿周边杂草上的检出，预示着4种病毒可能通过杂草在田间进行传播。 豇豆花叶病毒属的成员包含有两条RNA序列。对MsSV1的全基因组序列进行分析，发现不含poly（A）尾，RNA1全长为5784 个核苷酸（nt）、RNA2为3343 nt，分别包含1个开放阅读框（Open Reading Frame，ORF）并编码1820个氨基酸（aa）和1009 aa 的多聚蛋白（polyprotein），显示了MsSV1的CP（Large coat protein and Small coat protein）氨基酸序列与豇豆花叶病毒属的其他成员在CP氨基酸水平上的序列同源性为20.04%-31.81%；MsSV1的Pro-Pol（Pro: proteinase; Pol: RNA-dependent RNA polymerase）的氨基酸序列与豇豆花叶病毒属的其他成员在Pro-Pol氨基酸水平上的序列同源性为21.75%-33.78%，应为豇豆花叶病毒属的新成员。利用MsSV1和伴生豇豆病毒科的9个病毒属内的部分病毒以及一些未归属的病毒基于多聚蛋白构建系统进化树，显示了MsSV1与豇豆花叶病毒属的成员聚在一起，应为豇豆花叶病毒属的成员。利用摩擦接种和注射接种的方法，将MsSV1接种豌豆、大豆（Glycine max）、豇豆（Vigna unguiculata）、蚕豆（Vicia faba）、丝瓜（Luffa cylindrica）和番茄（Solanum lycopersicum）的健康种苗，发现以上植物均上不可被MsSV1侵染，其寄主范围有待进一步研究。 |
| 并列题名： | Identification of Virus Species in Alfalfa and Surrounding Weeds in Partial Regions of Tibet by Deep Sequencing |
| 题名主题： | 深度测序 紫花苜蓿 西藏 病毒鉴定 病毒分布 豇豆花叶病毒属 学位论文 |
| 中图分类： | S435.4-533 |
| 个人名称等同： | 常峰华 著 |
| 个人名称次要： | 陈功 指导 |
| 个人名称次要： | 兰平秀 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |