ISBN/价格: | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
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作品语种: | chi |
出版国别: | CN 530000 |
题名责任者项: | 利用热带玉米R146挖掘开花期相关QTL/.孙家臣著/.番兴明指导 |
出版发行项: | 2023.5.30 |
载体形态项: | 56页:;+图表:;+30cm |
一般附注: | 农学与生物技术学院, 学号2020210162 |
提要文摘: | 玉米(Zea may L.)是全球最大的粮食作物,玉米花期性状受到多因素调控,挖掘玉米花期相关候选基因对玉米花期分子机制研究、玉米种质改良具有指导意义。本研究通过两个来自热带的自交系R146与其早花期自然突变体ER146杂交产生F1代后自交产生901个单株的F2群体,吐丝期(DTS)是玉米花期的一个重要性状,在F2群体内挑选玉米吐丝期极早和极晚植株各30株,构建两个极端DNA混池进行集群分离分析(BSA),在分析中采用的分子标记为单核苷酸序列(SNP)和插入缺失(InDel)标记,利用BSA中的欧氏距离(ED)算法与ΔSNP-index/ΔInDel-index算法相结合,获得控制吐丝期性状基因的数量性状位点(QTL)和微效位点,并对候选基因进行功能注释。主要结果如下: (1)BSA的吐丝期相关QTL和微效位点定位分析。通过ED值方法在全基因组中获得5个ED-QTL,分别位于1、2、3、8、9染色体,其中3号染色体上存在范围最大、峰值最高的ED-QTL,该QTL区间大小22.2Mb共包含402个基因。基于上述ED-QTL进一步通过ΔSNP-index/ΔInDel-index方法在此ED-QTL内检测出1个区间范围为0.268Mb的主效ΔSNP-QTL (ΔSNP-qDTS3-2)和19个微效位点。 (2)候选基因相关功能注释。通过对主效ΔSNP-QTL内4个基因和微效位点上的13个基因共17个基因进行功能注释,注释结果发现主效ΔSNP-QTL内的1个基因、9个微效位点中的5个基因与玉米花期相关,包括MYB转录因子、类转录辅抑制因子SEUSS、转录因子GRAS、JINGUBANG类似蛋白。此外还在主效ΔSNP-QTL发现了2个潜在的玉米花期新基因,这2个基因无功能注释与相关同源基因信息,且仅存在于少数玉米基因组中。 本研究检测出的QTL与相关基因为玉米花期QTL热点区域研究、基因表达量分析、功能验证研究提供理论基础,为BSA方法定位此类玉米复杂数量性状提供了实践依据,同时也对热带玉米改良温带种质提供有效途径。 |
并列题名: | Using Tropical Maize R146 to Mine QTLs for Flowering Time eng |
题名主题: | 玉米 花期 集群分离分析 基因定位 欧氏距离 学位论文 |
中图分类: | S330-533 |
个人名称等同: | 孙家臣 著 |
个人名称次要: | 番兴明 指导 |
团体名称等同: | 云南农业大学 授予 |
记录来源: | CN YNAUL 20240510 |