书目详细信息
： 云南烟草丛顶病两种新病毒全序列分析及复合病原物检测
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00(估)缴送 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 云南烟草丛顶病两种新病毒全序列分析及复合病原物检测/.吕婧著/.李凡指导 |
| 出版发行项： | 2016.6 |
| 载体形态项： | 67页:;+图表 :;+30cm |
| 提要文摘： | 烟草丛顶病（Tobacco bushy top disease，TBTD）是一种由多种病原物复合侵染引起的特殊烟草病害，目前该病害在我国仅云南有发生。云南烟草丛顶病已报道的病原物主要为烟草丛顶病毒（Tobacco bushy top virus，TBTV）、烟草丛顶病毒卫星RNA（Tobacco bushy top virus satellite RNA, TBTV-SatRNA）、烟草扭脉病毒（Tobacco vein distorting virus，TVDV）和烟草扭脉病毒相关RNA（Tobacco vein distorting virus-associated RNA，TVDVaRNA）。2014年，本实验室在云南烟草丛顶病病株中又发现了2种新的暂命名为NPV1和NPV2的病原物，目前获得了NPV1 5716nt的核苷酸序列，获得了NPV2 5086nt的核苷酸序列，根据获得的NPV1和NPV2部分核苷酸序列的比对结果，这两种新病毒均属于马铃薯卷叶病毒属（Polerovirus）成员。本文主要围绕TBTD的病原物进行了检测和鉴定研究，得到以下结果：利用基因组步移法扩增获得了NPV1的基因组全序列，序列全长为5716nt。NPV1基因组结构符合Polerovirus基因组结构特征，含有ORF0、ORF1、ORF2、ORF3、ORF4和ORF5等6个ORFs。5端非编码区和3端非编码区分别长50nt 和143nt，ORF0 nt 51-nt794，长度为744 nt，编码28 kDa的蛋白；ORF1 nt184- nt2094，长度1911nt，编码约69kDa的蛋白；ORF1与ORF2 nt184-nt3362，通过-1位移码翻译表达118kDa的融合蛋白；ORF2与ORF3之间间隔一个200nt非编码区，ORF3 nt3561-nt4169，长度为609nt，编码 22.4kDa的外壳蛋白；ORF4 nt3592- nt4143，长度为552nt，编码20.4kDa的蛋白；ORF5连接ORF3终止密码子，nt3561-nt5573，长度为2012nt，以通读方式表达74kDa的蛋白。NPV1与黄症病毒科中28个病毒成员的基因组全序列核苷酸同源性范围为46.8%~66.9%；NPV1与云南烟草丛顶病复合病原物中的马铃薯卷叶病毒属成员TVDV的基因组全序列同源性仅为 56.5 %，证实NPV1是马铃薯卷叶病毒属的一个新种，建议将其命名为云南烟草扭脉病毒1号（Yunnan Tobacco vein distorting virus 1，YNTVDV-1）。扩增获得NPV2的近全长基因组序列5086nt，包括完整的ORF3、ORF4和ORF3-ORF5。ORF3长度为621nt，编码 22.6kDa的蛋白；ORF4长度为471nt，编码17.1kDa的蛋白；ORF3-ORF5长度为2190nt，编码P3-P5，大小为81.2kDa 的通读蛋白。NPV2与马铃薯卷叶病毒属其他病毒3个编码区的氨基酸序列同源性在25.9%~91.3%之间，NPV2 5086nt的近全长基因组序列与TVDV、PeVYV和PYLCV相应部位的核苷酸序列同源性分别为86 %、86 %和84%，证实NPV2是马铃薯卷叶病毒属的一个新种，建议将其命名为云南烟草扭脉病毒2号（Yunnan Tobacco vein distorting virus 2，YNTVDV-2）。建立了云南烟草丛顶病6种病原物的一步法多重RT-PCR检测技术，能快速、灵敏、特异和准确地完成田间感病样品中6种病原物的同步检测。对2014年-2015年采集的342个烟草样品进行了6种病原物的检测，有36个样品检测到云南烟草从顶病1-6种病原物，平均检出率为10.5%，其中TBTV的检出率为 1.2 %，TBTV-SatRNA的检出率为 2.3%，TVDV的检出率为10.5%，TVDVaRNA的检出率为4%，YNTVDV-1的检出率为0.9%，YNTVDV-2的检出率为1.2%。单独感染TVDV的样品有22个，检出率为6.4%；没有检测到单独感染其他5种病原物的样品。2个样品复合感染了6种病原物，检出率为0.58%；有1个样品复合感染了5种病原物，检出率为0.29%；复合感染4种病原的样品有3个（检出率为0.88%）。感染了TVDV＋TVDVaRNA＋TBTV-SatRNA＋TBTV 4种及其以上病原物的烟株样品都表现出明显的烟草丛顶病症状，在这个4个病原物基础上有无两个新病原物YNTVDV-1和YNTVDV-2，症状上没有显著的差异。从检测结果可以看出TVDV是6种病原物中传播效率最高的一种，病原物的复合侵染依赖于TVDV和TVDVaRNA。对2012年-2013年采集的244个田间烟草样品进行了云南烟草丛顶病2种新病毒的检测，在不考虑云南烟草丛顶病其他4种病原物的情况下，YNTVDV-1单独侵染的样品有8个，检出率为3.28%；YNTVDV-2单独侵染的样品有59个，检出率为24.18%；YNTVDV-1和YNTVDV-2复合侵染的样品有13个，检出率为5.33%。YNTVDV-2在田间的检出率显著高于YNTVDV-1。而且发现YNTVDV-1和YNTVDV-2既可各自与云南烟草丛顶病的其他病原物复合侵染，YNTVDV-1和YNTVDV-2也可以共同与云南烟草丛顶病的其他病原物一起复合侵染。对云南烟草丛顶病6种病原物的自然寄主及越冬寄主进行了调查分析，表明TVDV 寄主范围非常广泛，其寄主包括茄科的辣椒、十字花科的萝卜、白菜和甘蓝，菊科的莴苣和禾本科的小麦。而且TVDVaRNA与TVDV一起能够侵染豆科的蚕豆和十字花科的萝卜；云南烟草丛顶病的其他4病原物均未检测到；在其他作物上未检测到云南烟草丛顶病的6种病原物。 |
| 并列题名： | Analysis of the Complete Genome of Two New Viruses and Detection of the Complex Pathogens of Tobacco Bushy Top Disease in Yunnan eng |
| 题名主题： | 云南烟草丛顶病 病原物 检测 云南烟草扭脉病毒1号 云南烟草扭脉病毒2号 |
| 中图分类： | S432.41-533 |
| 个人名称等同： | 吕婧 著 |
| 个人名称次要： | 李凡 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |