书目详细信息
： 产蛋与停产武定鸡卵巢转录组基因差异表达分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00(估)缴送 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 产蛋与停产武定鸡卵巢转录组基因差异表达分析/.吴梦著/.叶绍辉指导 |
| 出版发行项： | 2019.6.5 |
| 载体形态项： | 60页:;+图表:;+30cm |
| 提要文摘： | 武定鸡是产于云南省楚雄彝族自治州武定县的肉蛋兼用地方鸡种，其就巢性强，产蛋量低。卵巢具有排卵调节、生殖激素分泌等功能，直接影响繁殖能力。转录组学越来越多的运用于发掘特定条件下细胞或组织的差异表达基因，是筛选相关功能基因的重要途径。目前，对武定鸡繁殖性能的研究还没有很大进展。因此，本研究利用转录组测序对产蛋期武定鸡卵巢组织进行转录组学分析，以期获得与武定鸡繁殖相关差异表达基因，为研究武定鸡的繁殖性状提供理论依据。 本研究以270日龄正常产蛋（LE）和停产一周以上（SLE）的武定鸡为实验对象，利用Illumina HiSeq PE150对其卵巢组织进行转录组测序，共得到546 471 256条高质量序列（Clean Reads），总计167.72 Gb。通过基因序列水平分析，统计可变剪切和SNP，预测新转录本及转录因子；通过基因表达水平分析，筛选差异表达基因，进行GO富集分析和KEGG富集分析，获得差异表达基因参与的生物学过程和信号通路，筛选与繁殖相关的差异表达基因。主要研究结果如下： （1）基因序列水平发现，LE与SLE组差异可变剪切事件共有431个，筛选出SNP共1048575个，其中LE特有的SNP有287066个，SLE特有的SNP有304715个，LE和SLE共有的SNP有456794个。 （2）LE与SLE组相比，共筛选出差异表达基因1198个，其中有758个差异表达基因（上调基因）在LE组中表达高于SLE组，440个差异表达基因（下调基因）在LE组中表达低于SLE组。上调基因如MMP11、APOD等可能在产蛋调节中起重要作用。 （3）对差异基因进行GO富集分析，发现上调基因与下调基因在分子功能、细胞组分、生物进程三个部分的富集比例基本一致，在细胞组分中，主要富集在细胞部分、细胞器、膜部分；在生物进程中，主要富集在细胞过程、生物调节、代谢过程；在分子功能中，主要富集在结合、催化活性、信号转导活性。在生物进程中，有17个差异表达基因富集在繁殖条目，46个差异表达基因富集在繁殖过程条目，包括一些与卵巢卵泡发育，排卵相关的基因。 （4）对差异表达基因进行KEGG富集分析，发现差异表达基因显著富集在Toll样受体信号通路、用于IgA生成的肠道免疫网络、细胞凋亡等通路。也揭示了一些重要的功能途径。如催乳素信号通路中上调基因PI3K能通过抑制Foxo2a 的表达，来抑制卵巢缺陷；类固醇激素生物合成中上调基因SUCT2B1能促进雄激素、雌激素的分泌；cAMP信号通路中上调基因NFKB1能促进AMH的表达，促进卵泡的生长发育。 |
| 并列题名： | Differential Expression Analysis of Ovary Transcriptome Genes between Laying Period and Laying off Period Wuding Chicken |
| 题名主题： | 武定鸡 卵巢 转录组测序 GO富集分析 KEGG富集分析 学位论文 |
| 中图分类： | S831.2-533 |
| 个人名称等同： | 吴梦 著 |
| 个人名称次要： | 叶绍辉 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20200312 |