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： 高黎贡山猪繁殖相关基因FKBP4、NPM2和FZD2的分子克隆、组织表达、多态性及关联分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 高黎贡山猪繁殖相关基因FKBP4、NPM2和FZD2的分子克隆、组织表达、多态性及关联分析/.杨圆圆著/.刘永刚, 唐中林指导 |
| 出版发行项： | 2023.05.25 |
| 载体形态项： | 60页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2021240402 |
| 提要文摘： | 母猪繁殖力在猪生产养殖中起着至关重要的作用，FKBP4、NPM2和FZD2基因是与繁殖相关的重要基因。本研究以高黎贡山猪为试验材料，通过RACE-PCR克隆高黎贡山猪的FKBP4、NPM2和FZD2基因。利用生物信息学工具，分析FKBP4、NPM2和FZD2基因的DNA及蛋白质序列特性，利用实时荧光定量PCR，对三个基因在猪不同组织部位的表达情况进行分析，最后，利用PCR+测序方法，对这三个基因编码区序列在具有产仔数记录的200头高黎贡山猪群体中进行多态性分析，并对FKBP4、NPM2、FZD2基因进行充分探讨其是否可作为与高黎贡山猪繁殖相关的候选基因，并进行后续研究，本研究具体试验结果如下： 1. FKBP脯氨酰异构酶4(FKBP Prolyl?Isomerase 4，FKBP4)也被称为FK506结合蛋白52（FKBP52），是一种广泛表达的肽基脯氨酰异构酶。本研究获得了全长为1577-bp的高黎贡山猪FKBP4基因的cDNA序列，通过利用GenScan软件对FKBP4的cDNA序列进行基因预测，发现该基因共编码456个氨基酸，其蛋白质等电点为4.90，分子量为12.67kDa。 该基因编码蛋白与欧亚獾、 北美河獭、红狐、加利福尼亚海狮、斑海豹分别具有92.81%、92.59 %、92.16%、92.16 %、91.94 %的高度同源性。该蛋白具有两个FKBP_C superfamily保守结构域。计算机辅助分析显示，FKBP4基因的基因组序列包含10个外显子和9个内含子，总长度7441-bp。进一步分析表明，猪FKBP4基因编码区存在7个突变位点。通过对200头高黎贡山猪FKBP4基因编码区扩增及测序，发现在200头高黎贡山猪群体中无多态性。组织表达分析表明，猪FKBP4在脾脏、脂肪中中高度表达，在心脏、肌肉、肝脏、肺脏、卵巢、肾脏中呈中度表达。 2.?NPM2蛋白 (Nucleophosmin/Nucleoplasmin 2)，又称核纤溶蛋白，NPM2是一种在核伴侣蛋白中表达的基因，主要在卵母细胞和卵子中表达。本研究获得全长为991-bp的高黎贡山猪NPM2基因的cDNA序列，通过利用GenScan软件对NPM2的cDNA序列进行基因预测，发现该基因共编码219个氨基酸，其蛋白质等电点为5.05 ，分子量为7.90kDa。该基因编码蛋白与小头鼠海豚、 野生双峰驼、羊驼、龙眼骆驼、斜腹蜥分别具有83.33%、79.09 %、79.09%、77.03%、76.82 %的高度同源性。该蛋白具有一个 Nucleoplasmin-like domain保守结构域。计算机辅助分析显示，NPM2基因的基因组序列包含8个外显子和7个内含子，总长度13898-bp。进一步分析表明，猪NPM2基因编码区存在5个变异体和4个突变位点。通过对200头高黎贡山猪NPM2基因编码区扩增及测序，发现在200头高黎贡山猪群体中无多态性。组织表达分析表明，猪NPM2在肌肉、脾脏、卵巢、肾脏中高度表达，在心脏、肺脏、肝脏、脂肪中中度表达。 3.?卷曲蛋白2（Frizzled2，FZD2)，相关研究表明FZD2基因影响卵巢发育。本研究获得了全长为1941-bp的高黎贡山猪FZD2基因的cDNA序列，通过利用GenScan软件对FZD2的cDNA序列进行基因预测，发现该基因为编码558个氨基酸，蛋白质等电点为4.85?，分子量为16.32kDa。该基因编码蛋白与牛、 大矛鼻蝠、美洲赤鹿、大蹄蝠、狨猴分别具有97.85%、97.85%、97.85%、97.67%、97.31%的高度同源性。该蛋白具有?Cysteine-rich Wnt-binding domain和CRD_domain cysteine-rich domain保守结构域。计算机辅助分析显示，该基因的基因组序列包含1个外显子，总长度1649bp。进一步分析显示，猪FZD2基因编码区存在24个突变位点。通过对200头高黎贡山猪FZD2基因编码区扩增及测序，发现FZD2基因突变位点C166A与高黎贡山猪产仔数关联，高黎贡山猪FZD2基因突变位点C166A中基因表达为AA基因型的总产仔数（TNB）、产活仔数（NBA）均显著高于基因表达为CC基因型和CA基因型（P <0.05）。组织表达分析表明，猪FZD2在心脏、脾脏、卵巢中呈中高度表达，在肌肉、肺脏、肝脏、脂肪、肾脏中呈中度表达。 这些试验结果为进一步研究FKBP4、NPM2和FZD2基因作为高黎贡山猪繁殖相关候选基因的可能性奠定了分子基础。 |
| 并列题名： | Molecular cloning, tissue expression, polymorphism and association analysis of reproduction related genes-FKBP4 , NPM2 and FZD2 in Gaoligong pigs eng |
| 题名主题： | 猪 FKBP4 NPM2 FZD2 分子克隆 组织表达 多态性 学位论文 |
| 中图分类： | S813.1-533 |
| 个人名称等同： | 杨圆圆 著 |
| 个人名称次要： | 刘永刚 指导 |
| 个人名称次要： | 唐中林 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |