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： 云南地方山羊群体遗传多样性与起源分化研究
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 云南地方山羊群体遗传多样性与起源分化研究/.杨明著/.叶绍辉, 苗永旺指导 |
| 出版发行项： | 2021.06.02 |
| 载体形态项： | 41页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2017210296 |
| 提要文摘： | 云南邻近东南亚，位于青藏高原与云贵高原交汇地区，由于特殊的地理位置和生态环境，加之众多的少数民族经济发展水平和养殖习惯的差异，使云南形成了丰富的地方山羊遗传资源，但迄今对云南地方山羊的遗传多样性与起源分化尚未有人全面的进行系统的遗传学研究。本研究以mtDNA D-loop区序列为遗传标记，采用PCR产物直接测序对云南主要地方山羊群体包括凤庆无角黑山羊、龙陵黄山羊、罗平黄山羊、马关无角山羊、弥勒红骨山羊、宁蒗黑头山羊、云岭山羊和昭通山羊共346个个体进行了群体变异检测，结合从NCBI下载的云南圭山山羊群体的15条mtDNA D-loop区序列，用群体遗传学方法对所得数据进行了深入的分析。另外以Y-STR和Y-SNP为标记，分析龙陵黄山羊、罗平黄山羊、马关无角山羊、云岭山羊和昭通山羊共80个个体的Y染色体遗传结构及其父系起源。研究结果如下： （1）共获得361个个体的mtDNA D-loop区序列，序列长度为1211-1214bp之间。云南地方山羊A、T、C、G四种碱基的平均含量分别为31.1%、28.8%、25.9%、14.2%，其中A+T平均含量为59.9%，G+C平均含量为40.1%，A+T含量显著高于G+C含量。共检测到多态位点303个，其中包括70个单一变异位点，231个简约信息位点和2个三碱基突变位点。在303个多态位点中，有289个位点发生转换，12个位点发生颠换，转换和颠换比为24.08，还有2个位点转换与颠换共存。 （2）云南地方山羊群体总体单倍型多样度为0.996，平均核苷酸多样度为0.01958，平均核苷酸差异数23.634。核苷酸多样度最高是罗平黄山羊（0.02024），其最低是龙陵黄山羊（0.00998）。 （3）云南地方山羊群体间遗传距离范围在0.013-0.053之间；云岭山羊和龙陵黄山羊之间遗传距离最近，弥勒红骨山羊与昭通山羊之间遗传距离最远。云南地方山羊可分为两个地理类群，类群间的遗传变异占整个变异的57.876%（P＜0.01），类群内群体间变异为6.648%（P＜0.01），群体内部遗传变异为35.476%（P＜0.01），云南地方山羊群体之间没有显著的遗传分化。 （4）在云南地方山羊群体中共定义了252种单倍型，系统发育分析表明，云南地方山羊单倍型可聚为A、B两大支。其中A支系包括218种单倍型，B支系包括34种单倍型，揭示云南地方山羊群体拥有两个母系起源。云南山羊群体与野山羊群体的系统发育分析表明，角骨羊与云南地方山羊A支系聚为一类，从而得出云南地方山羊母系起源之一是角骨（Capra aegagrus）。 （5）云南5个地方山羊在SRYM18位点上存在3个片段大小差异，分别为105bp、106bp和107bp，在SRY基因片段上检测到4个多态性位点（g.95G>T、g.2603T>A、g.2670A>G和g.2990G>A）。构建了3种单倍型（Y1A, Y1B和Y2），Y1A为优势单倍型。NJ系统进化树发现：5个地方山羊品种没有形成各自的分支，而是以3种单倍型的聚类分支形式存在，其中Y1A和Y1B单倍型的遗传距离最近。5个地方山羊品种Y染色体遗传多样性较低，种群间没有发生显著的遗传分化，可能存在3种父系起源。 以上结果揭示云南地方山羊群体遗传多样性丰富，存在A和B两个母系起源，其中一个祖先是角骨羊 (Capra aegagrus）。本研究结果揭示了云南地方山羊的遗传多样性、起源与分化，对云南地方山羊的品种划分、保种与选育利用具有重要价值。 |
| 并列题名： | Genetic Diversity and Origin of Indigenous Goat Populations in Yunnan eng |
| 题名主题： | 山羊 线粒体DNA控制区 Y染色体 遗传多样性 起源进化 学位论文 |
| 中图分类： | S827-533 |
| 个人名称等同： | 杨明 著 |
| 个人名称次要： | 叶绍辉 指导 |
| 个人名称次要： | 苗永旺 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20220620 |