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： 侵染立枯丝核菌AG-3与AG-4部分病毒的分子特性及功能研究
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY40.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 侵染立枯丝核菌AG-3与AG-4部分病毒的分子特性及功能研究/.孙爱丽著/.杨根华指导 |
| 出版发行项： | 2023.5.26 |
| 载体形态项： | 146页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 植物保护学院, 学号2019110044 |
| 提要文摘： | 立枯丝核菌（Rhizoctonia solani Kǜhn）是一种寄主范围广且地理分布广泛的植物病原真菌，其中立枯丝核菌AG-3和AG-4引起许多经济作物叶斑及立枯病。真菌病毒是能够在真菌中进行复制和增殖的病毒，多数真菌病毒对寄主不表现任何症状，但一些真菌病毒可以引起寄主的致病力降低，从而成为对抗植物真菌病害的潜在生物防治剂。本研究对分离自云南省烟草、马铃薯、四季豆及苋菜植株上隶属于立枯丝核菌AG-3和AG-4中的病毒多样性进行分析，并对两个新病毒与两个低毒双分病毒分离株的分子特性及功能进行了研究。研究结果如下： 立枯丝核菌AG-3和AG-4共114个菌株，按24组混合样品进行高通量测序和分析。两个立枯丝核菌融合群共获得125个contigs注释到了真菌病毒，其中在数量上显示优势的是线粒体病毒科的病毒（33个）和双分病毒科的病毒（19个），分别占总contigs数量的26.4%和15.2%。经序列拼接获得几乎完整基因组的病毒共有26个，分别分布于以下病毒科，线粒体病毒科（Mitoviridae）（10个）、镰刀病毒科（Fusariviridae ）（6个）、内源病毒科（Endornaviridae）（3个）、减毒病毒科（Hypoviridae）（1个）、双分病毒科（Partitiviridae）（6个），在这些病毒序列中，有12个congtigs属于新病毒序列，表明立枯丝核菌两个融合群中的病毒多样性。 从立枯丝核菌AG-3获得新病毒Rhizoctonia solani fusarivirus 6（RsFV6）和Rhizoctonia solani virus 717（RhsV717）的分离株Rhizoctonia solani partitivirus BS5（RsPV-BS5）的全基因组序列。RsFV6全基因组序列长度为6141 nt，不包括长度为21 bp的poly（A）尾，包含有两个ORF。ORF1编码204.82 kDa的蛋白，该蛋白存在一个RdRp结构域和一个解旋酶结构域（Hel）。ORF2编码18.37 kDa的蛋白，在ORF2中未检测到保守结构域。基于RdRp氨基酸序列进行聚类分析，RsFV6与Rhizoctonia solani fusarivirus 3最为相似，同源性是70.67%，是镰刀病毒科Alphafusarivirus的新成员。RsPV-BS5全基因组由两条dsRNA组成，dsRNA-1全长2580 bp，包含一个大的ORF1，编码RdRp蛋白，长度是730 aa；dsRNA-2全长2444 bp，包含一个小的ORF2，编码CP蛋白，长度是683aa。经氨基酸多重比对与系统发育分析，RsPV-BS5属于Rhizoctonia solani virus 717的一个新分离株。RsPV-BS5的病毒颗粒呈球形，直径约为40nm左右。RsPV-BS5具有减缓烟草靶斑病菌和马铃薯黑痣病菌菌丝生长，降低烟草靶斑病菌产孢，降低寄主致病力，具有生防潜力。在传播方式方面，RsPV-BS5可以进行水平传播、垂直传播，不能进行体外传播和跨界传播。通过对携带RsPV-BS5菌株BS5与未携带RsPV-BS5菌株YBS-5毒素提取及磷素外渗测定，RsPV-BS5可以降低磷素外渗，从而降低寄主对烟草的致病力。此外，通过菌株06-2-15V与06-2-15转录组测序表明，存在许多差异表达基因，这些基因主要参与次生代谢产物合成代谢、肽的合成和代谢，甲基转移酶和细胞色素P450酶大量基因上调表达，从而抑制丝核菌生长；细胞壁降解酶相关基因的下调表达，解析了病毒RsPV-BS5与寄主真菌相互作用的机制。 从立枯丝核菌AG-4获得新病毒Rhizoctonia solani mitovirus 106（RsMV-106）和Rhizoctonia solani partitivirus 2（RsPV2）的分离株Rhizoctonia solani partitivirus HX2C（RsPV-HX2C）的全基因组序列。RsMV-106的全基因组长度为2794 nt，存在一个ORF，编码RdRp蛋白，分子质量为95.76 kDa。在其基因组的两个末端，AUG为起始密码子，UAAUAG为两个连续的终止密码子。在RsMV-106的5' -和3' - UTRs预测了两个潜在的茎环结构，ΔG的值分别为-17.0 kcal/mol和-8.80 kcal/mol。经氨基酸多重比对与系统发育分析表明，RsMV-106属于线粒体病毒科Duamitovirus的一个新成员。通过构建RsMV-106的侵染性克隆，转染后再生菌株菌丝生长速率看出，RsMV-106感染立枯丝核菌生长有一定促进作用。此外，RsMV-106可以进行水平传播，但其他传播方式未知。RsPV-HX2C全基因组由两条dsRNA组成，dsRNA-1全长1988bp，包含一个大的ORF1，编码RdRp蛋白，长度是623 aa；dsRNA-2全长1788bp，包含一个小的ORF2，编码CP蛋白，长度是489aa。其两条dsRNA末端比对分析，5’-UTR表现高度保守，而3’ -UTR则出现间断的poly（A）尾。经氨基酸多重比对与系统发育分析，RsPV-HX2C属于Rhizoctonia solani partitivirus 2的一个新分离株。RsPV-HX2C的病毒颗粒呈球形，直径约为26nm左右。在传播方式方面，RsPV-HX2C可以进行水平传播，其它传播方式未知。RsPV-HX2C能减慢寄主真菌菌丝生长，导致立枯丝核菌的致病力下降，从而具有生防潜力。 本研究对立枯丝核菌AG-3和AG-4融合群的真菌病毒多样性进行了分析，扩充了立枯丝核菌的病毒资源，并对具有生防潜力的两个双分病毒进行了深入研究，为立枯丝核菌引起的烟草靶斑病及马铃薯黑痣病等病害提供一种生物防治策略。 |
| 并列题名： | Study on molecular characterization and function of partial viruses infecting AG-3 and AG-4 in Rhizoctonia solani eng |
| 题名主题： | 立枯丝核菌 真菌病毒多样性 正单链RNA病毒 双分病毒 低毒力 学位论文 |
| 中图分类： | Q939.5-533 |
| 个人名称等同： | 孙爱丽 著 |
| 个人名称次要： | 杨根华 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |