书目详细信息
： 大理天门冬性别分化关键基因的挖掘与表达互作分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 大理天门冬性别分化关键基因的挖掘与表达互作分析/.李云宾著/.刘正杰指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.15 |
| 载体形态项： | 90页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 农学与生物技术学院, 学号2020210131 |
| 提要文摘： | 植物性别分化是植物生殖生物学领域的一个热点研究方向。转录组测序技术为研究植物性别分化提供了一种高通量、高效、高精度的方法。大理天门冬为我国西南地区特有，处于性别分化早期的天门冬属物种，是天门冬物种演化，特别是性别决定机制和性染色体起源研究的重要材料。本研究利用转录组测序技术、花发育或性别分化相关基因家族鉴定和蛋白间互作研究了大理天门冬的性别分化，并初步探讨了其分子机制。研究结果如下： （1）转录组测序数据质量良好，经过质控后得到了大量高质量的清洗数据，共获得135Gb的Clean reads，各个样品的Q30值均在93%以上。在花组织比较中（MFvsFF）中，一共筛选到2597个差异表达基因，在根组织的比较（MRvsFR）中，一共筛选到3072个差异表达基因，在茎组织的比较（MSvsFS）中，一共筛选到1684个差异表达基因。通过进一步的筛选，找到1424个差异基因，这些基因为花中特异表达基因，这些表达差异基因可能与大理性别分化相关。进一步进行GO功能分析发现，雌花中高表达基因主要涉及生殖相关的生物学过程，如胚后形态进程、花器官发育、雌蕊发育和生长素等；而雄花中高表达基因则主要涉及花粉发育、配子发育相、植物发育、细胞生长、形态建成、离子转运以及授粉等生物学过程。 （2）一共鉴定到73个MADS-box基因家族成员、136个MYB基因家族成员、141个bHLH基因家族成员以及36个DUF247基因家族成员，并对它们编码蛋白的理化性质、启动子顺式作用元件、保守基序、系统进化关系以及基因表达量进行分析。大多数基因在每个样本中都有表达，这种广谱表达模式与它们作为大理天门冬生长发育重要调节因子相一致。然而，一些基因呈现出组织特异表达模式，它们仅在花组织中特异表达，在花发育或性别分化中发挥着重要的作用。 （3）一共筛选到43个可能参与大理天门冬性别分化的差异表达基因，这些基因主要参与花发育、花粉发育、花粉萌发以及配子发育途径。 （4）我们对其中33个差异表达基因的表达模式进行了验证，结果表明这些差异表达基因的表达水平在不同的组织和不同的植株中具有一定的差异，这表明这些基因在性别分化中具有稳定的表达模式。此外，我们还发现一些差异表达基因与花器官发育、绒毡层发育、授粉等生物学过程密切相关，这些结果表明这些基因在调控植物性别分化过程中起着重要作用。 （5）通过酵母双杂交实验，验证AtaTDF1（属于MYB基因家族成员，基因ID为Ata07G005870）和AtaAMS（属于bHLH基因家族成员，基因ID为Ata07G029840）之间存在着较强的互作关系，初步推测AtaTDF1和AtaAMS可能形成异源多聚体的形式形成转录复合调控因子，在大理天门冬性别分化过程中起着重要作用。 综上所述，我们利用转录组测序技术深入研究了大理天门冬的性别分化，并发现了一些性别特异性基因和转录因子，这些基因和转录因子参与了大理天门冬性别分化过程中的调控。这些结果为进一步探究大理天门冬性别分化分子机制提供了重要的参考。 |
| 并列题名： | Mining and expression interaction analysis of key genes of sex differentiation in Asparagus taliensis |
| 题名主题： | 大理天门冬 转录组测序 性别分化 绒毡层发育 自交不亲和 学位论文 |
| 中图分类： | S567.239-533 |
| 个人名称等同： | 李云宾 著 |
| 个人名称次要： | 刘正杰 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |