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： 滇南小耳猪和迪庆藏猪肠道菌群及代谢物的研究
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 滇南小耳猪和迪庆藏猪肠道菌群及代谢物的研究/.方晨著/.赵素梅指导 |
| 出版发行项： | 2021.05.31 |
| 载体形态项： | 58页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2018210301 |
| 提要文摘： | 猪肠道微生物及代谢产物受品种、环境等因素影响，对机体健康有重要作用。滇南小耳猪和迪庆藏猪均是云南优良地方猪种的典型代表。因此，本研究通过16S rRNA高通量测序和代谢组学对滇南小耳猪和迪庆藏猪粪便样品进行研究，对比分析差异菌群及差异代谢物，并筛选相关优势菌群，结果如下： 1. 滇南小耳猪和迪庆藏猪肠道微生物的分析 在滇南小耳猪和迪庆藏猪肠道微生物组成中，滇南小耳猪和迪庆藏猪门水平的优势菌群依次为厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、放线菌门（Actinobacteria）、螺旋菌门（Spirochaetes）、变形菌门（Proteobacteria）等。在属水平上，滇南小耳猪和迪庆藏猪的优势菌群依次为Terrisporobacter、拟杆菌属（Bacteroides）、乳酸杆菌属（Lactobacillus）、未分类的梭菌属（unidentified_Clostridiales）、双歧杆菌属（Bifidobacterium）、柔嫩梭菌属（Faecalibacterium）、未分类的瘤胃菌属（unidentified_ Ruminococcaceae）等。 对比分析滇南小耳猪与迪庆藏猪的肠道微生物，在门水平排名前十的菌群中，迪庆藏猪没有而滇南小耳猪拥有的菌群为2个，疣微菌门（Verrucomicrobia）和Synergistetes，滇南小耳猪没有而迪庆藏猪拥有的菌群为2个，Kiritimatiellaeota和纤维杆菌门（Fibrobacteres）。在属水平排名前十的菌群中，迪庆藏猪没有而滇南小耳猪拥有的菌群为4个，双歧杆菌属（Bifidobacterium）、栖粪杆菌属（Faecalibacterium）、消化链球菌属（Streptococcus）和布劳特氏菌属 （Blautia），滇南小耳猪没有而迪庆藏猪拥有的菌群为4个，未分类的普雷沃氏菌属（unidentified_Prevotellaceae）、脱硫弧菌属（Desulfovibrio）、未分类的螺旋体属（unidentified_Spirochaetaceae）和Romboutsia。 滇南小耳猪和迪庆藏猪肠道微生物多样性存在差异。迪庆藏猪的Chao1指数、ACE指数均显著高于滇南小耳猪（P<0.05），迪庆藏猪的肠道微生物丰富度和多样性更高。UPGMA聚类树、PCoA分析图均显示出滇南小耳猪和迪庆藏猪各自聚类，滇南小耳猪和迪庆藏猪菌群结构差异大，肠道微生物组成不同。 滇南小耳猪和迪庆藏猪存在差异显著菌群。基于LEfSe分析进一步筛选到40个差异物种，滇南小耳猪的毛螺菌科（Lachnospiraceae）、放线菌属（Actinomyces）、丁酸弧菌属（Butyricicoccus）、罗氏菌属（Rothia）、Ignavibacteria显著高于迪庆藏猪，迪庆藏猪的纤维杆菌（Fibrobacteria）、瘤胃球菌属（Ruminococcus）、 瘤胃球菌_sp_YE281、普雷沃氏菌（Prevotellaceae）、δ变形菌（Deltaproteobacteria）、芽单胞菌（Gemmatimonadales）、Bradymonadale、出芽菌属（Gemmata）、柔膜菌（Mollicutes）等显著高于滇南小耳猪（P<0.05）。 肠道微生物功能分析预测，滇南小耳猪的差异菌群主要参与的代谢途径为胱氨酸和蛋氨酸的代谢、类固醇生物合成、倍半萜和三萜的生物合成、硫代谢、碳代谢、氨基酸的生物合成、次生代谢产物的生物合成；迪庆藏猪的差异菌群主要参与精氨酸和脯氨酸的代谢、泛醌及其他萜类醌的生物合成、辅酶因子的生物合成、次生代谢产物的生物合成。 2.滇南小耳猪和迪庆藏猪代谢物的分析 滇南小耳猪和迪庆藏猪代谢物组成方面，PLS-DA图和聚类分析热图显示滇南小耳猪和迪庆藏猪的代谢物表达模式是各不相同，表现出品种间代谢产物的差异。正离子模式下，迪庆藏猪没有但滇南小耳猪拥有的代谢物为3-（2-氧代-2,3-二氢-1,3-苯并恶唑-3-基）丙酸、醋氨苯酸，滇南小耳猪没有但迪庆藏猪拥有的代谢物为(+)-阿非迪霉素、壬酸酯；负离子模式下，迪庆藏猪没有但滇南小耳猪拥有的代谢物为糖精，滇南小耳猪没有但迪庆藏猪拥有的代谢物为脱氧胆酸。 PLS-DA模型进一步筛选出差异显著的代谢物，在正离子模式下，滇南小耳猪和迪庆藏猪相比共有124个显著差异的代谢物，主要是氟吡啶、二十碳五烯酸、氢化可的松琥珀酸、Compound III(S)、(S)-ACPA、3-脱氢-6-脱氧甾酮、乙酰-L-亮氨酸-L-亮氨酸精氨酸、（2E，6Z）-N-乙基-2,6-壬二烯酰胺等，其中73个显著上调，51个显著下调；在负离子模式下，共有105个显著差异代谢物，主要是（2R）-1-{[[（2-氨基乙氧基）（羟基）磷酰基]氧基} -3-羟基-2-丙烷基（6Z，9Z，12Z，15Z）-6,9,12,15-十八碳六烯酸酯、乙草胺ESA、组氨酸-天冬氨酸等，其中50个显著上调，55个显著下调，不同差异代谢物之间也存在一定的相关性。 通过差异代谢物功能分析，发现6个显著差异的代谢通路，主要是类固醇生物合成、不饱和脂肪酸的生物合成、膦酸酯和次膦酸酯代谢、苯丙氨酸代谢、甲烷代谢、草酸衍生的生物碱的生物合成。 3.滇南小耳猪和迪庆藏猪的差异菌群和差异代谢物的关系分析 16S rRNA高通量测序和代谢组学技术联合分析，发现滇南小耳猪存在相同的胆固醇、钙化醇、豆甾醇代谢物参与相同的类固醇生物合成通路，相互印证了差异菌群与差异代谢物存在联系，滇南小耳猪特定的肠道微生物及其参与代谢通路发挥的功能与机体表现出强抗逆性、高抗病力相关。迪庆藏猪差异菌群富集于精氨酸和脯氨酸的代谢、苯丙氨酸代谢、甲烷代谢和草酸衍生的生物碱的生物合成通路，参与4个通路的代谢物存在相同的L-酪氨酸，差异菌群及代谢产物与免疫力、抗病力相关，符合迪庆藏猪耐高寒、强抗逆性和高抗病力特性。 综上，滇南小耳猪和迪庆藏猪的肠道微生物和代谢产物存在差异，通过比对分析和筛选两个品种的差异菌群与差异代谢物，发现两者间存在联系，发挥特定的功能维持机体健康，表现优良特性，但具体的作用机制需要进一步研究。 |
| 并列题名： | Study on the Intestinal Flora and Metabolites in Diannan Small Ear Pigs and Diqing Tibetan Pigs eng |
| 题名主题： | 滇南小耳猪 迪庆藏猪 肠道微生物 16S rRNA LC-MS 学位论文 |
| 中图分类： | S828-533 |
| 个人名称等同： | 方晨 著 |
| 个人名称次要： | 赵素梅指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20220620 |