书目详细信息
： ATCC31749基因组测序与可德胶合成操纵子基因的超表达研究
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00(估)缴送 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | ATCC31749基因组测序与可德胶合成操纵子基因的超表达研究/.张超著/.毛自朝指导 |
| 出版发行项： | 2016.5 |
| 载体形态项： | 71页:;+图表:;+30cm |
| 提要文摘： | 可德胶是一种是由D-葡萄糖以β-1，3糖苷键连接的葡聚糖，由于可德胶具有独特的凝胶特性，被广泛应用于食品、医药、农业建筑等领域。最初的可德胶发酵生产的菌株被命名为Alcalingenes faecalis Var mgxgenes10C3 ，后定名为Agrobacterium sp, 并自然突变改良为Agrobacterium sp.ATCC31749菌株。随着微生物基因组测序技术快速发展，为了从基因组水平上了解ATCC31749可德胶的合成与运输及调控过程提供了了可能。Ruffing等通过454测序技术，测定了该菌株的基因组并获95组装大片段（scaffolds）的框架图。为了更全面了解ATCC31749基因组的细节及其可德胶合成与调控的全貌，本研究拟通过三代SMAT测序技术获得该菌基因组的完成图，同时在基于基因组信息分析的基础上分别在该菌中单独或组合超表达来源于可德胶合成操纵子的基因crdA、crdS、crdC基因，以期获得高产的可德胶工程菌株并初步确定crdA和crdC在可德胶合成与运输中的功能。研究结果表明三代SMAT测序后经组装获得ATCC749基因组完成图，包含1环形和1线性染色体及两个质粒，经已测序的近源种进行全基因组比对分析确定ATCC749菌株与Agrobacterium fabrum str.C58最相似，初步将该菌株定名为Agrobacterium fabrum str.ATCC749。对ATCC31749的基因组序列进行生物信息学分析确定与可德胶合成运输相关的基因和调控因子，具体包括1）能量代谢相关基因；2）氮调节代谢相关基因；3）c-di-GMP调节相关基因；4）糖代谢相关的基因。并将前人研究ATCC31749可德胶合成操纵子含有crdA、crdS和crdC三个基因定位于线性染色体上。ATCC749可德胶合成操纵子中crdS被确定为可德胶合成酶的催化亚基，但crdA，crdC的具体功能未知，crdA、crdS、crdC的单个超表达体比野生型和对照菌株的产胶量都有很明显的提高，说明crdA、crdC可能参与可德胶合成调控或者运输过程，而用crdA和crdS的组合超表达菌株比crdA，crdS，crdC的单个超表达菌株有更高可德胶的产量上，说明crdA，crdS，crdC是以协同方式完成可德胶的合成与运输的。本研究为ATCC749中可德胶合成与调控机制的阐明及代谢工程方法构建高产可德胶菌株提供了实验基础和理论基础。 |
| 并列题名： | Genome sequencing of ATCC31749 and over-expression of curdlan synthesis operon genes eng |
| 题名主题： | 可德胶 ATCC31749基因组 合成运输 调控 |
| 中图分类： | Q939.91-533 |
| 个人名称等同： | 张超 著 |
| 个人名称次要： | 毛自朝 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20171023 |