书目详细信息
： 我国部分地区牛冠状病毒流行病学调查和S基因遗传进化分析
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 我国部分地区牛冠状病毒流行病学调查和S基因遗传进化分析/.张欣怡著/.肖啸，李晓成指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.1 |
| 载体形态项： | 72页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物医学院, 学号2020210417 |
| 提要文摘： | 牛冠状病毒（BCoV）是导致我国牛腹泻和呼吸系统疾病的主要病原之一，严重影响了全球养牛业的健康发展。该病毒可以感染牛，还能感染羊、野生反刍动物、猫甚至人，对该病毒的研究具有重要的公共卫生意义。本研究针对我国部分省份牛群感染BCoV情况进行流行病学调查，对流行毒株的S基因及全基因组序列进行扩增分析，掌握我国牛群BCoV感染状况及分布特点，明晰流行毒株S基因及全基因组分子特征及遗传演化规律，以期为BCoV相关疫病的防控提供科学依据。 1. BCoV流行病学调查：应用本实验室建立的BCoV实时荧光定量RT-PCR方法对2021-2022年采集自16个省份（直辖市/自治区）68个养牛场的1153份临床样品进行检测，阳性场占比为41.18%（28/68），阳性样品占比为10.49%（121/1153）。其中，临床健康牛群阳性场占比为36.36%，临床发病牛群阳性场占比为42.86%；发病牛群中，腹泻症候群阳性场占比为37.5%，呼吸道疾病症候群阳性场占比为50%。按牛只生长阶段来看，犊牛阳性个体检出率为20.68%，显著高于青年牛（0.15%）和成年牛（3.09%）；按季节分布来看，夏（14.93%）、冬（11.28%）两季占比较高，春（7.22%）、秋（7.36%）两季占比相对较低；按地理分布来看，东北、华南、华中地区阳性场占比较高，分别为69.23%、62.5%、50%，华北、华东、西北、西南地区阳性场占比相对较低，分别为25%、25%、17.65%、16.67%。可见，我国牛群感染BCoV现象普遍且广泛，在时间、空间、群间三个维度上均存在差异性分布特点。 2. BCoV S基因扩增分析：针对BCoV S基因序列设计7对特异性引物，用RT-PCR对BCoV阳性样品进行S基因分段扩增，共获得30条S基因序列。测序毒株核苷酸同源性介于97.7%-100%之间，氨基酸同源性介于97.2%-100%之间；测序毒株与GenBank上已发布的BCoV S基因参考序列核苷酸同源性介于96.7%-99.8%之间，氨基酸同源性介于95%-99.9%之间。系统进化分析表明，BCoV 毒株分为欧洲（GI 型）和亚-美（GII 型）两大分支，所测毒株均属GII 型，且与大多中国参考毒株共同位于GII 中相对独立的分支。与中国已发布的参考毒株相比，所测毒株在42个氨基酸位点处存在点突变，毒株遗传演化的地域性特点较为明显，相同地区毒株S序列存在多处相同且有别于其他地区毒株的氨基酸突变，结果表明某些毒株可能拥有相同的祖先。 3. BCoV全基因组扩增分析：以GenBank中发布的BCoV参考毒株BCOV-China/SWUN/A1/2018（登录号：MN982198）全基因组序列为模板，设计31对特异性引物，用RT-PCR对BCoV阳性核酸进行全基因组的分段扩增，通过优化引物序列及反应温度等条件，最终从2021年来自宁夏回族自治区的牛粪便样品中扩增获得1条完整的BCoV全基因组序列，命名为BCoV/NX-1/2021/CHN。经序列比对和遗传进化分析，该毒株为BCoV，与BCoV参考毒株基因组序列核苷酸同源性为97.7%-99.5%。该毒株结构蛋白HE、S、E、M、N与BCoV3/2021/CHN、BCoV6/2021/CHN、BCoV_China/BCoV cattle_F226/2021毒株氨基酸同源性较高，结构蛋白的主要变异发生于HE和S蛋白。 综上，本研究通过对我国部分地区牛群BCoV感染情况进行了流行病学调查及S基因的遗传进化分析，结果显示，BCoV在我国临床发病牛群及健康牛群中感染均较为普遍，病毒在呼吸道疾病症候群和腹泻症候群中均发挥着重要作用，犊牛最为易感。我国BCoV流行毒株S基因在进化上呈现地域性聚集特点，S蛋白氨基酸变异存在多样性，且这种多样性与地域相关，与症候群、年份无明显关联。本研究揭示了我国牛群BCoV感染状况和分布特点，丰富了BCoV流行病学数据库，为深入开展BCoV分子流行病学研究提供了参考，为BCoV相关疫病的防控提供了流行病学依据。 |
| 并列题名： | Epidemiological investigation of bovine coronavirus and analysis of S gene genetic evolution in some parts of China |
| 题名主题： | 牛冠状病毒 流行病学调查 遗传进化分析 学位论文 |
| 中图分类： | S855.3-533 |
| 个人名称等同： | 张欣怡 著 |
| 个人名称次要： | 肖啸 指导 |
| 个人名称次要： | 李晓成 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |