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书目详细信息： 云南省猪圆环病毒2型、3型和4型的流行病学调查

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《云南省猪圆环病毒2型、3型和4型的流行病学调查》

ISBN/价格：	CNY20.00 (估\呈缴)学位论文
作品语种：	chi
出版国别：	CN 530000
题名责任者项：	云南省猪圆环病毒2型、3型和4型的流行病学调查/.李永荟著/.宋春莲指导
出版发行项：	2023.6.7
载体形态项：	53页:;+图表:;+30cm
一般附注：	动物医学院, 学号2021240450
提要文摘：	PCV2可造成免疫系统抑制引起猪的多种疾病综合征，是威胁我国生猪健康养殖的重要病原之一。PCV3和PCV4目前尚无有效的商品化疫苗。我国近年来各省均有3个病毒感染的报道。本研究拟建立PCV2、PCV3和PCV4的三重PCR方法，对云南省开展PCVs流行病学调查，明确猪圆环病毒的流行分布规律；对阳性样品的进行遗传进化分析，了解核苷酸和氨基酸序列的同源性和变异情况，对揭示我省猪圆环病毒流行及其病原生态学具有重要意义。、PCV3和PCV4三重PCR方法的建立本研究分别在NCBI Gene Bank数据库查找PCV2、PCV3和PCV4的基因序列，分别设计3对引物用于扩增PCV2、PCV3和PCV4的保守区域。构建重组质粒作为本方法的阳性质粒标准品，调整反应体系和条件，进行灵敏性、特异性试验。结果显示，三重PCR的灵敏性和特异性良好。云南省PCV2、PCV3、PCV4流行病学调查收集云南省2018-2022年16个地州市的养殖场、屠宰场、散养户、市场的3406份（脾脏、肺脏、淋巴结）样品进行三重PCR检测，对PCVs在不同年份、季节、地区和场点分布流行情况进行分析。在2018-2022年间，PCVs的总阳性检出率分别为62.24%。季节分布，PCV2和PCV3单独感染在秋季最高，阳性检出率为41.2%，26.64%；冬季最低，分别为35.17%，20.59%；二者混合感染在夏季最高，为27.65%，冬季最低，为24.57%。空间分布，在各地州市均存在PCV2和PCV3单独感染和混合感染情况，PCV2和PCV3阳性检出率最高的地区均为德宏(49.15%，31.19%)，最低的地区分别为昆明(28.66%)，昭通(17.68%)；混合感染率最高的地区为曲靖(38.33%)，最低的地区为临沧(15.04%)。场点分布，PCV2和PCV3在散养户阳性率最高，分别为87.23%、69.33%；在规模场和市场最低，分别为66.67%、23.95%。PCV2和PCV3混合感染在散养户最高(30.92%)，规模场最低(8%)。云南省PCV2和PCV3测序和遗传进化分析选取14株PCV2阳性样品进行全基因组，Cap基因和25株PCV3阳性样品的Cap基因测序分析，多序列比对分析核苷酸与氨基酸序列同源性、变异位点，构建遗传进化树。14株PCV2测序毒株全基因序列与参考序列之间的核苷酸同源性为93.6%~99.4%；Cap基因核苷酸变异位点分析显示在该区域存在碱基的插入和替换，无缺失现象；遗传进化分析有1株2a亚型、5株2b亚型、8株2d亚型。PCV3分型分析显示有4株3a亚型，5株3b亚型，16株3c亚型；Cap基因与参考毒株相比，核苷酸同源性为94%~99.5%，氨基酸突变位点分析显示，存在13处氨基酸位点发生替换，无插入和缺失。结论：建立的PCV2、PCV3、PCV4三重PCR检测方法检测效果稳定；在云南省PCVs的感染率较高，包括PCV2、PCV3的单独感染和混合感染；PCV2全基因核苷酸序列同源性较高，Cap基因核苷酸的变异程度较小，PCV2d为主要流行基因亚型。PCV3的Cap基因核苷酸同源性较高，测序毒株Cap蛋白氨基酸差异程度小，主要的流行毒株亚型为PCV3c。
并列题名：	epidemiological investigation of porcine circovirus types 2,3and 4 in Yunnan Province eng
题名主题：	猪圆环病毒病 PCR 流行病学调查遗传进化分析学位论文
中图分类：	S855-533
个人名称等同：	李永荟著
个人名称次要：	宋春莲指导
团体名称等同：	云南农业大学授予
记录来源：	CN YNAUL 20240529

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