书目详细信息
： 基于转录组和蛋白组筛选大、小型丽江猪肌纤维发育关键基因
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 基于转录组和蛋白组筛选大、小型丽江猪肌纤维发育关键基因/.刘金桥著/.严达伟指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.9 |
| 载体形态项： | 75页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2020210350 |
| 提要文摘： | 丽江猪是2015年发现的云南优良地方猪种，品种内存在大型和小型两个自然分离群，是在品种内解析肌肉生长发育遗传调控机制的理想猪种。本研究以新生期大、小型丽江猪背最长肌组织作为对象，比较肌纤维组织学特性，联合转录组和蛋白组筛选影响肌纤维发育的基因，主要结果如下： （1）在新生期，大型丽江猪肌纤维直径（5.28±0.34μm）和面积（21.96±2.89μm2）均低于小型丽江猪肌纤维直径（8.58±0.74μm）和面积（58.15±9.99μm2），差异极显著（P<0.01）。 （2）基于RNA-seq筛选到1833个差异表达基因，主要富集在骨骼肌细胞分化、成肌细胞分化的负调控、Rap1信号通路和胰岛素信号通路等；随机挑选8个差异表达基因进行qPCR验证，qPCR定量结果与转录组测序结果一致。基于DIA筛选到1071个差异表达蛋白，主要富集在肌动蛋白结合、胰岛素样生长因子受体结合、糖酵解/葡萄糖生成、胰岛素信号通路和mTOR信号通路等。 （3）通过RNA-seq和DIA数据联合分析，发现两组学差异均显著的基因呈高度正相关（Pearson相关系数0.72）。差异方向相同的基因有69个，主要富集在钙离子结合、糖酵解过程的正调节、脂肪细胞脂肪分解的调节、胰岛素信号通路和cGMP-PKG信号通路等。差异方向相同基因的互作网络显示：LDHA、SLC2A4、CKM、SORD、ACTN3、MSTN、AKR1B1、INSR和PDK4位于调控网络中心，与TRIM63、POSTN和MEF2D等基因存在互作。 （4）在新生期大型丽江猪背最长肌转录组和蛋白组中，MSTN和AMPD1显著下调，INSR、MEF2D、FKBP5和POSTN显著上调，促进成肌细胞增殖、分化和融合，可能增加肌纤维数量；LDHA显著下调，PDK4、PPM1B和TRIM63显著上调，抑制肌管融合和细胞生长，加速肌肉蛋白质水解，最终可能抑制肌纤维肥大；SORD和AKR1B1显著下调，抑制细胞对葡萄糖的利用，从而抑制肌肉蛋白质合成，最终可能减缓肌纤维肥大；INSR、SLC2A4和FKBP5显著上调，CKM显著下调，维持能量供应，促进蛋白质合成，可能抑制FBXO32和TRIM63上调导致的蛋白质降解；ACTN3、PDK1和SLC16A3显著下调，可能增加了新生期大型丽江猪背最长肌中慢收缩肌纤维比例。 （5）在新生期小型丽江猪背最长肌转录组和蛋白组中，MSTN和AMPD1显著上调，INSR、MEF2D、FKBP5和POSTN显著下调，抑制成肌细胞增殖、分化和融合，可能抑制肌纤维数量增加；INSR、SLC2A4和FKBP5显著下调，CKM显著上调，抑制蛋白质合成，可能延长肌纤维增长时间；LDHA显著上调，PDK4、PPM1B和TRIM63显著下调，促进肌管融合和细胞生长，减缓肌肉蛋白质水解，可能促进肌纤维肥大；SORD和AKR1B1显著上调，促进细胞对葡萄糖的利用，促进肌肉蛋白质合成，可能促进肌纤维肥大；ACTN3、PDK1和SLC16A3显著上调，可能增加了新生期小型丽江猪背最长肌中快收缩肌纤维比例。 本研究通过对转录组和蛋白组联合分析，筛选到LDHA、PDK4和PPM1B等17个肌纤维发育关键基因。新生期大型丽江猪中LDHA、SORD和AKR1B1下调，PDK4、PPM1B和TRIM63上调，抑制肌纤维肥大，可能导致新生期大型丽江猪肌纤维直径小于小型丽江猪；ACTN3、PDK1和SLC16A3下调，可能增加新生期大型丽江猪背最长肌中慢收缩肌纤维比例；INSR、SLC2A4、FKBP5、MEF2D和POSTN上调，CKM、MSTN和AMPD1下调，增加肌纤维数量，可能导致新生期大型丽江猪肌纤维密度高于小型丽江猪。研究结果可为进一步探究丽江猪肌纤维发育的调控机制奠定基础。 |
| 并列题名： | Screening of key genes for muscle fiber development in Large and Small Lijiang pigs based on transcriptome and proteome eng |
| 题名主题： | 新生期丽江猪 转录组 蛋白组 肌纤维发育 差异基因 学位论文 |
| 中图分类： | S813.1-533 |
| 个人名称等同： | 刘金桥 著 |
| 个人名称次要： | 严达伟 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240516 |