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： 云南进口边贸即食食品中蜡样芽孢杆菌对β-内酰胺类抗生素耐药机制的研究
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 云南进口边贸即食食品中蜡样芽孢杆菌对β-内酰胺类抗生素耐药机制的研究/.李琪著/.胡永金, 王晓华指导 |
| 出版发行项： | 2021.06.02 |
| 载体形态项： | 81页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 食品科学技术学院, 学号2019240054 |
| 提要文摘： | 随着国际食品贸易全球化的发展，导致云南边贸即食食品存在很大的安全性问题，而蜡样芽孢杆菌（Bacillus cereus）是即食食品中广泛存在的食源性致病菌。β-内酰胺类抗生素（β-lactams）是临床治疗由B. cereus引起疾病的最常用药物，因此开展B. cereus对β-lactams耐药机制研究，对于食品安全及临床用药具有重要的理论及实际意义。本论文在前期研究基础上，使用纸片扩散法（Kirby-Bauer disk diffusion test,K-B法）对前期从云南进口边贸即食食品中分离鉴定出的220株B. cereus进行5类14种抗菌药物敏感性测定，确定菌株耐药谱；在其耐药表型的基础上筛选出6株多重耐药B. cereus进行全基因组de novo测序，并使用Glimm- -er、Repeat Masker、BLASTP、ResFinder、PlasmidFinder等软件进行生物信息学分析及通过与CARD数据库进行比对，筛选出耐β-lactams基因，从AcrAB蛋白、MarRA操纵子、AcrR抑制子、AmpC β-内酰胺酶等耐药相关基因进行耐药机制分析，深入探究云南进口边贸即食食品中B. cereus的耐β-lactams机制，为减轻和控制B. cereus耐药性的产生和传播以及为临床合理使用抗生素提供科学依据。本研究主要结果如下： 1.药敏试验结果表明220株B. cereus对β-lactams表现出极强的耐药性，220株B. cereus对AMP（氨苄西林）、AMX（阿莫西林）、TIC（替卡西林）、CTX（头孢噻肟）、CFT（头孢噻吩）、CAZ（头孢他啶）等6种 β-lactams均显示出高度耐药性，其中对TIC耐药的菌株高达200株，达到90.90%，其次是CAZ和AMX，均有193株。对氨基糖苷类抗生素产生耐药的菌株有36株，构成比为16.4%；B. cereus对磺胺类和喹诺酮类抗生素产生耐药性均有42株，构成比为19.1%；氯霉素类所占比例最少，仅有4.5%，由此判定氨基糖苷类、磺胺类、氯霉素类、喹诺酮类抗生素对B. cereus均有不同程度的抑制作用，可作为临床治疗的备用抗生素；同时发现有33株菌株为多重耐药菌，220株B. cereus中耐1类抗生素的菌株最多，有145株，达到65.9%，其中大多耐β- lactams；只有一株菌耐5类抗生素，编号为LY-51。共50个耐药谱，主导耐药谱为AMP+AMX+TIC +CTX+CFT+CAZ，共108株，占比49.1%，并且此耐药谱中的抗生素均属于β-la- -ctams。 2.筛选出6株多重耐药B. cereus进行全基因组de novo测序，对其进行生物信息学分析及功能注释。基因组测序结果显示6株B. cereus的染色体序列长度在2.06Mb ~4.69Mb之间，GC含量在39.68%~57.03%之间，染色体测序平均覆盖深度在139X~1151X。有3株B. cereus注释到了质粒，LY TB 89-5和LY-2有一相同大小的质粒，均为130850bp，LY-51的质粒大小为130851 bp。6株B. cereus预测到的编码基因数量依次为4006、3346、5046、4017、4469、3980，在COG功能类别注释到最多的是Carbohydrate transport and metabolism（碳水化合物运输和代谢），GO注释菌株功能偏向Catalytic activity（催化活性），KEGG功能注释中得到较多基因注释的代谢通路是Carbohydrate metabolism（碳水化合物代谢）及Environmental Information Processing（环境信息处理）。 3.通过CARD数据库注释，筛选出对β-lactams耐药的21个耐药基因，分析其耐药机制。3个质粒中不存在插入序列，转座子及整合子，判断6株B. cereus都是由染色体介导的耐药，无质粒介导。预测到30个均匀分布于菌株染色体上的基因组岛，并发现8个与β-lactams相关的耐药基因，耐药机制均为抗生素主动外排机制。通过注释beta-lactam resistance及two-component system通路图发现，基因组中存在青霉素结合蛋白3、外膜蛋白tolC、膜融合蛋白acrA及3类β-内酰胺酶，并且两个通路中共同注释到了染色体编码的AmpC(ampicillin cepha mycinase, AmpC)β-内酰胺酶，可判定B. cereus通过主动外排系统的外排泵作用，降低β-lactams在菌体中的药物浓度，从而对此类抗生素产生耐药，其主要的外排系统为染色体DNA上的AcrAB-TolC外排泵。此外，AmpCβ-内酰胺酶的产生，水解了β-内酰胺类抗生素的β-内酰胺环，也是其耐药机制之一，而由青霉素结合蛋白（PBPs）所引起的抗生素靶点改变还需做进一步分析。本研究中的B. cereus对β-lactams耐药十分严重，有必要在临床治疗前对病原进行耐药性检测。 |
| 并列题名： | Study on the resistance mechanism to β- lactams antibiotics of Bacillus cereus in imported border trade instant food of Yunnan Province eng |
| 题名主题： | 进口食品 蜡样芽孢杆菌 全基因组测序 耐药性 耐药机制 学位论文 |
| 中图分类： | TS207.4-533 |
| 个人名称等同： | 李琪 著 |
| 个人名称次要： | 胡永金 指导 |
| 个人名称次要： | 王晓华 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20220608 |