ISBN/价格: | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
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作品语种: | chi |
出版国别: | CN 530000 |
题名责任者项: | 亚洲杂草稻表型变异及苗期稻瘟病抗性分子基础解析/.何玉著/.陈丽娟,李东宣指导 |
出版发行项: | 2023.5.20 |
载体形态项: | 61页:;+图表:;+30cm |
一般附注: | 农学与生物技术学院, 学号2020210154 |
提要文摘: | 杂草稻某些表型性状优异而且变异能力极强,具有突出的对不良环境的抗病逆性和适应性,是水稻品种改良的优质基因库。本研究主要以收集于亚洲和部分美洲不同国家稻区的175份杂草稻资源为试验材料,对杂草稻农艺性状表型变异和稻瘟病苗期叶瘟抗性进行鉴定,并利用GSR 40 K水稻高密度全基因组SNP芯片进行稻瘟病抗性资源的基因组遗传差异和相关功能基因等分析。通过56K水稻SNP芯片进行全基因组SNP位点多态性检测,将供试材料稻瘟病抗性相关表型数据与SNP基因型数据相结合来进行全基因关联分析,发掘出亚洲杂草稻资源稻瘟病苗期叶瘟抗性相关基因位点及功能注释候选基因。 主要结论如下: 1、杂草稻主要农艺性状表型变异分析结果表明,供试材料在各农艺性状上类型广泛,差异明显,是优异的种质资源材料,测量的12个农艺性状的变异系数分布在14.0-121.8%之间,呈现出较大的变异范围,遗传多样性丰富。进行相关性分析得出,杂草稻外观品质性状与产量性状存在一定的显著相关性,其特有的果皮颜色与穗结实率呈极显著正相关,相关系数R为0.213,芒长、芒色与千粒重呈极显著正相关,相关系数R分别为0.304、0.322。 2、通过56K水稻SNP芯片检测分析,筛选出32,199个核心SNP位点,总共4,540,059个高质量SNP标记,绘制出亚洲杂草稻资源分子指纹图谱。 3、群体遗传结构分析结果明确与亚洲杂草稻资源系统发育树、主成分分析结果的高度一致,收集于中国的杂草稻资源群体的遗传多样性丰富,变异范围较大。各个不同国家来源的杂草稻群体之间存在着复杂且频繁的基因交流,是潜在的优质种质资源。为水稻稻瘟病抗性育种及品种改良提供了重要的物质基础和理论依据。 4、通过全基因组关联分析,定位到1个与亚洲杂草稻资源稻瘟病苗期叶瘟抗性性状显著相关的位于12号染色体上的SNP位点,在该位点所在的LD block内关联到14个SNP位点,注释到13个候选基因。 5、稻瘟病苗期叶瘟抗性鉴定结果表明,抗性水平在中抗以上杂草稻资源丰富、占比达40.6%,其中抗性水平表现为抗的材料有33份,分别来自老挝、中国、韩国、印度、巴西,占参试材料的18.8%;参试材料整体抗性表现较好,收集于中国的杂草稻资源数量最多且平均抗性较高,其中Cambodia31、Cambodia37、Cambodia42均含有4个稻瘟病抗病基因Pi5、Pid3、Pigm、Pita;高抗稻瘟病的柬埔寨杂草稻资源为籼粳中间型、纯合度高且同时携带其他优异抗病逆基因,为抗病育种的潜力基因资源。该研究为杂草稻资源的发掘利用提供了新视野。 该研究结合基因组和表型组关联分析,明晰亚洲不同地理分布的丰富的杂草稻资源的主要农艺性状表型变异,成功构建亚洲杂草稻资源分子指纹图谱,系统解析亚洲杂草稻资源的群体遗传结构,探索亚洲杂草稻资源的遗传进化趋势,筛选出可供水稻育种的抗病逆性相关的SNP分子标记及杂草稻资源,研究结果将有助于揭示亚洲杂草稻资源稻瘟病抗性形成的分子机制、发掘对稻瘟病抗性育种有重要贡献的关键基因位点(SNP标记),进一步推动杂草稻有利资源的开发利用,为杂草稻资源的发掘利用提供新思路,为水稻抗稻瘟病优良品种的分子设计育种奠定基础。 |
并列题名: | Analysis of the molecular basis of phenotypic variation and rice blast resistance in Asian weedy rice |
题名主题: | 亚洲杂草稻资源 苗期稻瘟病抗性 56K SNP 功能基因分析 GWAS 学位论文 |
中图分类: | S435.111-533 |
个人名称等同: | 何玉 著 |
个人名称次要: | 陈丽娟 指导 |
个人名称次要: | 李东宣 指导 |
团体名称等同: | 云南农业大学 授予 |
记录来源: | CN YNAUL 20240301 |