书目详细信息
： METTL14调控绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化的作用及机制研究
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估\呈缴)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | METTL14调控绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化的作用及机制研究/.陈倩著/.叶绍辉，赵倩君指导 |
| 出版发行项： | 2023.6.20 |
| 载体形态项： | 67页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 动物科学技术学院, 学号2020210349 |
| 提要文摘： | 羊肉的产量和品质依赖于骨骼肌卫星细胞的发育，探究骨骼肌卫星细胞增殖分化调控机制对于提高瘦肉率等经济性状具有重要意义。N6甲基腺苷（m6A）修饰是最为普遍的一种RNA甲基化修饰，m6A修饰对骨骼肌生长发育、脂肪生成以及成骨分化等生物学过程具有重要的调控作用。但关于m6A修饰对于绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化的机制研究还比较匮乏。本研究以绵羊骨骼肌卫星细胞为研究对象，基于RNA-seq方法构建绵羊骨骼肌卫星细胞增殖期与分化期的转录组图谱；进一步对增殖期绵羊骨骼肌卫星细胞进行干扰METTL14，再利用MeRIP-seq方法绘制m6A表达图谱，以解析METTL14对绵羊骨骼肌卫星细胞增殖的调控机制。主要结果如下： （1）对绵羊骨骼肌卫星细胞增殖期（D0）和分化期（D7）的6个细胞样品进行RNA-seq；每个样品均获得至少6.9Gb数据量，参考基因组比对率均在92%以上；平均Q20、Q30分别在96%、91%以上。以|log2Fold Change| ≥ 2和q < 0.01为筛选差异表达基因的标准，共鉴定到1954个差异表达基因（DEGs），其中有1288个DEGs上调表达和666个DEGs下调表达。这些DEGs显著富集于AMPK、PI3K-Akt、Wnt等信号通路。基于前50个上调DEGs和前50个下调DEGs构建PPI互作网络，鉴定到MYBPC1、AREG和MYH1等枢纽基因参与绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化。另外，还鉴定到一些与骨骼肌卫星细胞发育有关的免疫因子，包括IL-6和IL-11。 （2）对绵羊骨骼肌卫星细胞增殖期和分化期的转录组数据进行可变剪切分析，共鉴定到1479个可变剪切事件，包括1050个SE、98个RI、128个A3SS、100个A5SS和103个MXE。SE占整个可变剪切事件的70.99%，表明在绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化过程中前体mRNA的可变剪切事件主要是以SE为主。其中，这个发生可变剪切的基因主要富集在MAPK、PI3K-Akt等信号通路。此外，在本研究中共注释到253个转录因子，其中一些被报道与绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化有关，包括MEF2C、NR4A2、FOXM1、SSRP1等。 （3）METTL14对绵羊骨骼肌卫星细胞增殖分化具有调控作用。研究发现干扰METTL14促进绵羊骨骼肌卫星细胞增殖，并且抑制绵羊骨骼肌卫星细胞分化。 （4）对试验组（siMETTL14）和对照组（siNC）的6个细胞样品进行MeRIP-seq测序；并且每个样品均得到大于5 Gb的原始数据，每个文库的Q20和Q30分别不小于98%和94%。在两个组中分别鉴定到10122个peaks和10405个peaks、分别注释到4232个基因和4420个基因。KEGG结果显示差异m6A peaks和差异m6A 基因富集于Wnt、Hippo、Notch信号通路。 （5）对siNC组和siMETTL14组的RNA-seq和m6A-seq数据进行整合，分析鉴定到TCF7、ALOX12、PANX3、CTF1和ISLR等基因表达与其m6A修饰具有一定相关性，我们推测这些基因可能通过METTL14介导的m6A修饰水平调控绵羊骨骼肌卫星细胞增殖。 综上，本研究围绕绵羊骨骼肌卫星细胞，利用RNA-seq测序技术构建细胞增殖分化的表达谱，鉴定到参与细胞增殖分化的关键基因。此外，本研究首次构建绵羊骨骼肌卫星细胞增殖期干扰METTL14的m6A表达图谱，对阐明m6A修饰参与骨骼肌卫星细胞增殖调控机制具有重要意义。 |
| 并列题名： | Effects and mechanisms of METTL14 during proliferation and differentiation of ovine skeletal muscle satellite cell |
| 题名主题： | 绵羊 m6A-seq RNA-seq 骨骼肌卫星细胞 METTL14 学位论文 |
| 中图分类： | Q23-533 |
| 个人名称等同： | 陈倩 著 |
| 个人名称次要： | 叶绍辉 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20240301 |