书目详细信息
： 基于抗性表型与全基因组关联分析的马蹄莲抗软腐病基因的挖掘
书目信息 机读格式(MARC)
| ISBN/价格： | CNY20.00 (估)学位论文 |
|---|---|
| 作品语种： | chi |
| 出版国别： | CN 530000 |
| 题名责任者项： | 基于抗性表型与全基因组关联分析的马蹄莲抗软腐病基因的挖掘/.张琪著/.吴红芝指导 |
| 出版发行项： | 2021.05.24 |
| 载体形态项： | 62页:;+图表:;+30cm |
| 一般附注： | 园林园艺学院, 学号2018210153 |
| 提要文摘： | 胡萝卜软腐果胶杆菌（Pectobacterium carotovora subsp. carotovora, Pcc）引起的软腐病是桎梏彩色马蹄莲（the colored Zantedeschia）产业健康发展的重要病害，选育、种植抗软腐病马蹄莲品种是控制彩色马蹄莲软腐病发生的重要手段，而抗性品种的选育依赖于对遗传背景不同的抗性种质资源进行表型及基因层面的筛选、鉴定与发掘。近年来，利用全基因组学的方法鉴定、分离抗病基因已成为分子抗病育种的主要手段。本研究以123份具有不同遗传背景的马蹄莲为供试材料，通过筛选明确马蹄莲Pcc抗性鉴定的适宜方法后，对123份马蹄莲材料进行Pcc抗性鉴定；利用全基因组重测序技术获得高质量SNP位点，开展供试材料的群体结构及分子特征分析；利用Tasssel 软件进行Pcc抗性的全基因组关联分析，筛选与马蹄莲抗Pcc关联的SNP位点，进而挖掘马蹄莲Pcc抗性基因。主要研究结果如下： （1）通过细菌16S rDNA测序及回接试验鉴定表明，获得的6个Pcc菌株中，Pcc3菌株致病性较强，可用于后续接种试验；马蹄莲离体接种（整片叶、叶盘）和田间活体接种（主脉、侧脉）结果表明，离体接种的最佳材料为整片叶，最佳病情统计时间是24h；田间活体接种的最佳部位是叶片主脉，最佳病情统计时间是36h。 （2）为了明确马蹄莲种或品种的抗性特征，对123份马蹄莲种或品种进行田间Pcc抗性鉴定，抗性评价结果显示，除 Z. aethiopica为抗性（R）水平外，其余材料表现为中抗和感病水平，其中，42份材料为中抗（MR），占比34.15%；56份材料为感病（S），占比45.53%；24份材料为高感(HS)，占比19.51%。 （3）基于全基因组重测序获得的8,119,383高质量SNP位点，开展123份马蹄莲材料的遗传多样性和群体结构分析。结果表明，123份马蹄莲共分为3个亚群，亚群1包含5个品种，亚群2包含14个品种，亚群3包含104个品种。 （4）全基因组关联分析结果表明，在-log P≥4.5水平下共检测到11个与马蹄莲软腐病抗性显著关联的SNP位点，其中7个位于LG07号染色体上，可解释8.54%~10.36%的表型变异，其余4个分别位于LG03、LG06、LG08和LG09号染色体上，分别解释8.22%、9.88%、8.63%和8.25%的表型变异。研究结果为进一步精确定位和挖掘马蹄莲软腐病抗性基因奠定了坚实的基础。 |
| 并列题名： | Identification of resistance gene to soft rot based on phenotype resistance and genome wide assocation analysis in Zantedeschia eng |
| 题名主题： | 马蹄莲 软腐病 抗病基因 全基因组关联分析 学位论文 |
| 中图分类： | S432.42-533 |
| 个人名称等同： | 张琪 著 |
| 个人名称次要： | 吴红芝 指导 |
| 团体名称等同： | 云南农业大学 授予 |
| 记录来源： | CN YNAUL 20220609 |