ISBN/价格: | CNY20.00(估)缴送 |
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作品语种: | chi |
出版国别: | CN 530000 |
题名责任者项: | 长期相对高、低温对肉鸡盲肠微生物多样性的影响/.李星著/.潘洪彬指导 |
出版发行项: | 2019.05.29 |
载体形态项: | 73页:;+图表:;+30cm |
提要文摘: | 温度是影响肉鸡生产性能与健康的主要环境因子之一,也是制约现代规模化肉鸡养殖生产效益的主要因素。冷、热应激均会引起畜禽肠道微生物多样性变化和功能紊乱,目前研究多集中在短期冷热应激对肉鸡生产性能和肠道健康的影响等方面,但长期的环境温度变化对畜禽肠道微生物多样性及其功能的影响鲜见报道。因此,本试验选取240只新生的1日龄雄性艾维茵肉仔鸡,随机均分为3组,无抗生素添加的NRC两阶段日粮饲喂,地面平养,以北京畜禽育种公司肉鸡饲养管理手册的温度控制参数为对照,分别设定高温组(1d,36.5℃,HC组)、对照组(1d,33.5℃,CC组)和低温组(1d,30.5℃,LC组),各组环境温度随日龄平行递减,至42日龄分别降至22℃、19℃和16℃,其它饲养条件一致。各组随机选取12只体重相近的42日龄肉鸡屠宰,采集盲肠食糜,之后进行16S rRNA基因测序,通过对肠道微生物OTU聚类、物种注释与丰度统计、LEfSe组间差异分析和KEGG Pathway功能预测等生物信息学分析,探讨在不同环境温度条件下肉鸡盲肠微生物多样性及功能的变化规律。 试验结果显示: 1)36个肉鸡盲肠微生物16S rRNA样品共产生2,100,180 条clean reads,平均长度为414 bp。高温组、对照组和低温组分别获得460,537和547个OTU,三组共有OTUs数量为364个,各组特有OTUs的数量分别为31、80和113个。 2)在门水平,对肉鸡盲肠微生物相对丰度≥1%的菌门进行统计分析显示,对照组主要由拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)组成。与对照组相比,高温组中放线菌门(Actinobacteria)的丰度显著降低0.77%(P<0.01);低温组中拟杆菌门(Bacteroidetes)的丰度显著降低14.85%(P<0.05)、厚壁菌门(Firmicutes)的丰度显著增加11.92%(P<0.05)、放线菌门(Actinobacteria)的丰度显著降低0.65%(P<0.01)。同时,与高温和对照组相比,低温组中厚壁菌门与拟杆菌门(Firmicutes/ Bacteroidetes)的比率(ratio,r=1.32)分别显著增加0.42 (高温组,r=0.90,P=0.018) 和 0.69 (对照组,r=0.63,P<0.001);与对照组比,高温组中厚壁菌门与拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidetes)的比率增加,但无显著性变化(P>0.05)。 3)在属水平,对肉鸡盲肠微生物相对丰度≥1%的菌属进行统计分析显示,对照组主要由拟杆菌属(Bacteroides)、巴氏杆菌(Barnesiella)、Alistipes、粪杆菌属(Faecalibacterium)、梭菌属(Clostridium XlVa 和Clostridium IV)组成。与对照组相比,高温组中巴氏杆菌属(Barnesiella)显著降低11.05%(P<0.01),相炭疽杆菌属(Phascolarctobacterium)显著增加1.36%(P<0.05),Parabacteroides显著增加1.73%(P<0.01),肠球菌属(Enterococcus)显著增加0.72%(P<0.01);低温组中巴氏杆菌(Barnesiella)显著降低14.14%(P<0.01),Alistipes显著降低1.45%(P<0.05),粪杆菌属(Faecalibacterium)显著增加2.30%(P<0.05)。 4)LEfSe分析显示:高温组肉鸡盲肠微生物中厚壁菌门(Firmicutes)的肠球菌属(Enterococcus,LDA=3.66,P<0.001)、Turicibacter(LDA=2.59,P=0.001)和Erysipelotrichaceae Incertae Sedis(LDA=3.16,P=0.037),对照组中拟杆菌门(Bacteroidetes)的Alistipes(LDA=3.89,P=0.008)、巴氏杆菌属(Barnesiella,LDA=4.82,P=0.003)和放线菌门(Actinobacteria)的双歧杆菌属(Bifidobacterium,LDA=3.21,P=0.045),低温组中变形菌门(Proteobacteria)的Pandoraea(LDA=3.97,P<0.001)均显著增加。 5)基于各组肉鸡盲肠微生物OTUs进行KEGG Pathway数据库功能富集分析显示:高温组肉鸡盲肠微生物的环境信息进程(Environmental Information Processing)和代谢(Metabolism)两大类的信号通路显著富集,低温组盲肠微生物的细胞过程(Cellular Processes)、代谢(Metabolism)和基因调控(Genetic Information Processing)三大类的信号通路显著富集。 综上结果表明:长期相对高温环境使肉鸡盲肠微生物多样性减少,厚壁菌门(Firmicutes)中的肠球菌属(Enterococcus),Turicibacter和Erysipelotrichaceae Incertae Sedis丰度增加,环境信息进程(Environmental Information Processing)和代谢(Metabolism)两大类的信号通路富集;长期相对低温环境使肉鸡盲肠微生物多样性增加,厚壁菌门与拟杆菌门(Firmicutes/Bacteroidetes)的比率增加,变形菌门(Proteobacteria)的Pandoraea丰度增加,细胞过程(Cellular Processes)、代谢(Metabolism)和基因调控(Genetic Information Processing)三大类的信号通路富集,研究结果为开发新型微生态饲料添加剂,调控环境温度和保障肉鸡肠道健康提供新思路和可行途径,进而为提升肉鸡规模化健康养殖水平奠定理论基础。 |
并列题名: | Effects of Long-term Relative High and Low Temperature on Microbial Diversity of Cecum in Broilers eng |
题名主题: | 肉鸡 温度 16SrRNA基因测序 盲肠微生物 多样性 学位论文 |
中图分类: | S831.5-533 |
个人名称等同: | 李星 著 |
个人名称次要: | 潘洪彬 指导 |
团体名称等同: | 云南农业大学 授予 |
记录来源: | CN YNAUL 20200316 |